FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003636076

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003636076
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAGTTGGATCTTGGGAGCGGGCGGGCGGTCCGCCGCGAGGCGAGCCACCG26.666666666666667No Hit
CCGCAGCCCCGTCCAGCCGAGCCCGCAGCCCGTCGAGGATCGTGACGGTC26.666666666666667No Hit
TGGCATCGATCAGCGCATTCGCATCGTTGGCAAACTGCGCGGCGGAATAC26.666666666666667No Hit
CCATGGGCTGTGCCTTCATCAACCTCTGCATCTTGGCTTCACAGCATGCT26.666666666666667No Hit
ATTGATGGTGACTCACCCCGGCTGGATCTGCAAGCGATGTGGGCTGTGAG13.3333333333333335No Hit
CCATTGCATTCAGCCCGCTCTCCCAGTCATCACAGTCTGGTTTCTTGATA13.3333333333333335No Hit
GTCGTGTAGCGGTGAAAGTGGTTTGGTTTAGACGTCCGGGAATTGCATCT13.3333333333333335No Hit
CCCATGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTCCCATGTACTCTGCGTTGAT13.3333333333333335Clontech Universal Primer Mix Long (96% over 26bp)
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT13.3333333333333335No Hit
CCATGGGCTGTGACTTCATCAACCTCTGCATCTTGGCTTCACAGCATGCT13.3333333333333335No Hit
CCCCCGTTCGTCGGCTTGCACGGTGGGCCCAAGATGGTCCCAAGACCGTT13.3333333333333335No Hit
GAGTCTAATTTACTGGGATCTGTCAAGCTTTCATACCGGATTTTGTCCAA13.3333333333333335No Hit
AACAACCCCACCGCTTTGAATGACGGACTGGCGGCCCGGTGTCTGCCTGT13.3333333333333335No Hit
AATATACACTTGCAGATTCTACAAAAACCGTGTTTCCAAACTGCTCTGTC13.3333333333333335No Hit
GTCTGGCCTTTTGTCCTTGATCCTTGGTTAAGGAAATGACCAACCAGTAC13.3333333333333335No Hit
GAGCAGGGCTGCCTGGCCAGCGTGGGAGTCCTGACTCAGTCCTGCACCAC13.3333333333333335No Hit
ACCACCTGGTGTCTGCTACCATGAGTGGGGTCACCACCTGCCTGCGCTTC13.3333333333333335No Hit
GGCGGCGGTGGTGTCCCGGGTGAGGCCGTCCTGCACGGCGATCGAGCCGG13.3333333333333335No Hit
CGCCTGAAACGGCAGTGCTCAGCCGGCGGCCGTGGGGACTGCGGGCAACG13.3333333333333335No Hit
CCCTTGAGGTTGTCGATGTGCAGCGTGACGAAGGCGTGGTTCACGAAGCC13.3333333333333335No Hit
GTCCAGGGGGAAGAGGCTGATATAATCCTCAATGTCTTCGCGGTGTCTCT13.3333333333333335No Hit
TCCTTGACCATCTGCTCGTACTCCTCGTCTTTCATGGAGTCCAGGCCGCT13.3333333333333335No Hit
GTGGACGGCGGTGCCGGTGAAGGAGGGCAGGATCCCAAACTCGGCGACCG13.3333333333333335No Hit
GCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTTAAAACA13.3333333333333335No Hit
TTGCTGGTGACAGCAAAAATGACCCACCAATGGAAGCAGCTGGCTTCACT13.3333333333333335No Hit
GAACATCGGCTGGATGTTGGCCGGCCGCATGGTCGACGGCTTCACCATCG13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)