FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003641127

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003641127
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATGAAGGGTAACACTTTGGGAGATCGAGGCGGGTGGAATGCTTGAGCT213.333333333333334No Hit
CGGCAGGATTGTTAGAAAGTTAGTTGCCGTATAGACGGCATCAGTGGGGA16.666666666666667No Hit
GCTCCAGACCGACCAGACGGTCCTTCTTGAACGCTGTCTCTTATACACAT16.666666666666667No Hit
CCCACCGACCAAACGTCCACAGACTCCTCCTGGGCTTCGGCATCTTCCTC16.666666666666667No Hit
GGCCTCGGGCGTGGTCAGGCCCAGGATGCATTTCAGCAGCACCGATTTGC16.666666666666667No Hit
GAGGTGACGCAACCAGTAGATCGACATTCCGGGCGGAAAAATCATCCACA16.666666666666667No Hit
CATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCATGT16.666666666666667No Hit
CCTCGGCCGGTCCCGGCTGCATCGCCAGCACCGAGTTCGAGAAATACGAG16.666666666666667No Hit
CCTGCACTTCCCGAGGAGTGGACTTCAAAAGGCATGGCACGTTTAACCCG16.666666666666667No Hit
TCTTCCAACAGTAGCTTTAGCTGCTCTATCACCGGATGCATAGCCCAGGT16.666666666666667No Hit
ATGTTCTTGGTCGTGGTCGCTGCTTTCGTCCCCGCATCGGCCCTCTACGC16.666666666666667No Hit
ACCTTTTTACGCGTCGAAGATTTGTTGCGCTGACACTCTGCGCATGAAGG16.666666666666667No Hit
CCCCTGAAACCACTGCACGGTATTCCCTTTATGGTCAAAGATGGCACGTG16.666666666666667No Hit
GACTAAAGCGGGGCGGAACAGGCGGTTCGCCGTCTTCGAGGCAGGGCTGC16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)