FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003641128

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003641128
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CAAGCAATTCTCATGTCTCAACCTCCCAAGCAGCTGGGATTACAGGTGTG213.333333333333334No Hit
CCCGTATCCAGTCCCGCCCCGCCTGCTTGTTGCCCCGTGCGCTACGGTTG16.666666666666667No Hit
ACCTAACCCCACACACAAACAACTTGACACGCTCTGCTAACCCTGAGATG16.666666666666667No Hit
GAATACCCGCGATCCGATCTTCGCCGATTGGCGCGTGCGGCAGGCGATGA16.666666666666667No Hit
GGGATAGTGTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTACA16.666666666666667No Hit
GCAAAGGCTGCCTCCGCAGCGCGTACTACTGGCCAAACATGTGCAAGGAG16.666666666666667No Hit
GCCGTGGGGATCCTGGCCGCGAATTTCGTGCTGACGGGGTTGTTCTTCGA16.666666666666667No Hit
GTCCTGTGGTGGCATCGGCTGCGGCAGCCACAGTGTTGACGATGGTCTTC16.666666666666667No Hit
GTCTCCCGACTCACCGCCCGATTGGCCAGACGAACCACGAGCTGCTGAGT16.666666666666667No Hit
CGTTCAAGAAGGACCGTCTGGTCGGTCTGGAGCCTGTCTCTTATACACAT16.666666666666667No Hit
ATGTGGTAGTCGGCGGGGTCGATCCAGCGCGCGCCCGGCAACCCGCCGCG16.666666666666667No Hit
AAGTCCCTCAAGGGTAGTAACGAATTCGGCTTTGTGATCGGTCTCAGCTT16.666666666666667No Hit
CCCTTACACCCAGCGTGAACTTCTGGCGGTAGCTATCCCCACTGATGCCG16.666666666666667No Hit
CCGATAAGCAATGGTCTCCGTCCGAAGCGCTCCGCGACGAAGACCACGAA16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph