FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003641183

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003641183
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCTTGCGGAGTGGCGTCGGTATTAATGCTGTTGACGTCAACGGGAGCTTG23.3333333333333335No Hit
ATCTTGGACTAGTTAACACTTTTTAGATACTGGGTTGTATTTTTTTTCTG23.3333333333333335No Hit
ATAGATAGGAAATGGTTTTTAGAAATGTAAACGTGCCAGGCTCAGTTAAT23.3333333333333335No Hit
AACCGAGGCTCCGCGGCGCTGCCGTATCGTTCCGCCTGGGCGGGATTCTG23.3333333333333335No Hit
GTATTAATATGGACTCATATGCTTTATTAGTCTGTTTTCATGCTAATAAG23.3333333333333335No Hit
CTGTGGGTCGCGGCATGGGCCGAGGTGGCGCCCGCTGCAGCAGCGGCGGC23.3333333333333335No Hit
GATAATGAACAGGTTTTACCCCAGAACATGACCGTGCATCAGCTGATTCG11.6666666666666667No Hit
ATGTTGACCTGCACCTTGCCGGCCTGGTCGCGGCTCAGCCACAGCGGCGC11.6666666666666667No Hit
TAATGAATGTGAATGAATGTGTGTGATGGGATAGGTGTTGACATGTATAT11.6666666666666667No Hit
GACTAACAGGAGATTTCTCAGCAGAAATATCACAAGCCAGAATGGATCAG11.6666666666666667No Hit
GATGCAGTTGCAATTCTTGTTCCCTGCAGGTTGAGTGCAATGCAGCTCAG11.6666666666666667No Hit
TAATTCTAGAGCTAATACATGCCGACGGGCGCTGACCCCCTTCGCGGGGG11.6666666666666667No Hit
AAAACAATAAAATACCAAGGAATACAGCTAACTAGGGAAGTGAAAATCTA11.6666666666666667No Hit
CTTAAAGTGTACAGGAGGATGTGTGTAGGTTATATGCAAATCCTATGTGG11.6666666666666667No Hit
CAAAATCCAATGTAAAATGGACGAACTTTGAAAACATTATGCGAGTAAAA11.6666666666666667No Hit
GTATCCGCCTGGTTTCATGGGATTAGCTGCCTCCCTCTATTATCCACAAC11.6666666666666667No Hit
GGTCCAGACTTGGGAGAGATTTTAACAGAGATTGAGTATGCCATTGTCGA11.6666666666666667No Hit
GCTGAAAAGATGGCTCTAAGGACATACAAACAGTAAAGGACAGAACAAAG11.6666666666666667No Hit
GTTTTTAAAACCATCAGATCTCATGAGACTCATTCGCTATCACGAGAACA11.6666666666666667No Hit
GCAGAGATACTGCTAGTCTCCCCAGTTCTTTACAGTTGATACAGTTGTTC11.6666666666666667No Hit
GCTTAGAATGTACCAATGATTCGTTACTTACCCTAATGGAATATTGTGAG11.6666666666666667No Hit
GTGATGAGGGTTCAGCCTACTGGATCGCACACCAAGCAGTGAAAATAGTG11.6666666666666667No Hit
AGCAGGAACTGGTAGACCTGCGAGGGATGGCGCGGCAGCATCGATCCGCT11.6666666666666667No Hit
ATATGAGGAAATCCCGTTTCCAACGAAGGCCTCAAGTAGGTCTGAATATC11.6666666666666667No Hit
GCCGACCGGCGATGCGGCAGCGTTATTCCCATGACCCGCCGGGCAGCTTC11.6666666666666667No Hit
GGAATGGACTGGTATCAACCCGAGTGGAATGGAATGGAACGGAATGGAAT11.6666666666666667No Hit
CCATTAAGAGGACTTTGGCTTTCAGGGTAAATTGAAGGAAGCTCACGTAA11.6666666666666667No Hit
AAGTACACGACATCGGCTACCCAGGTCTCCGCCCCGAACACCGAAGTGTC11.6666666666666667No Hit
CTGTTGCTTTGAAAAATCTCATTATTTCTGGGCCGGGCATGGTGGCTCAC11.6666666666666667No Hit
GAATGGAATGGAATAATCCATGGACTCGAATGCAATCATCATCGAATGGA11.6666666666666667No Hit
CAATTGCACTTTTTAAGGGATATCGACAAGCAGTTTCTGTTTTCTAAAGG11.6666666666666667No Hit
GTATAATTTTAAGTCAGATAATGCAATTTCTCCAGTTTTGTTTTTTGCTC11.6666666666666667No Hit
GCAGAGATACTGCTAGTCTCCCCAGTTCTTTACAGTTGATACAGTTGTGC11.6666666666666667No Hit
GTCCAGGGTCAACTGCACCAGGCGCCGGGTGTTCGGGTCCATGGTGGTTT11.6666666666666667No Hit
CCGCATGGGTTGTGTGGATTGTCGGTGCCGTCATGACCCCTGTCTCTTAT11.6666666666666667No Hit
AGGTAATTTATCCCTGTTGTGAATAGCAAGGTTTTTTTCTTTCTTTTAGA11.6666666666666667No Hit
CTGTTCATACTGGTTGGCCATTTGTCTAACCTTTTTTCAAGGTTTTTAGC11.6666666666666667No Hit
GGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTGTGAG11.6666666666666667No Hit
GTCTCACGACGGTCTAAACCCAGCTCACGTTCCCTATTAGTGGGTGAACA11.6666666666666667No Hit
GTGGTGCACCCACGTAACGCGGCGCTGCTGCGGGCACAAGCTGTCTGGCC11.6666666666666667No Hit
AGAGAAGACTCAAATTAATAAAATCATGAATGAGGGATCCCTGGGCTGTC11.6666666666666667No Hit
GAGGAGCGAGCGACCAAAGGAACCATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCA11.6666666666666667No Hit
GGTGTGGTGGTGCACCTGTAGTCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAG11.6666666666666667No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTAGTAGAGA11.6666666666666667No Hit
TTCCAGTTCTAGTAAAACGTGCTAGGAAACAGCCTACTAAGTTGGTGGTA11.6666666666666667No Hit
CCTCGGGGAACCCTCTGGAGCCTCCAGCCAGCTGCTGCATCCTGGCAGAC11.6666666666666667No Hit
GAACTGCTCTATCAAAAGAAAGATCCACCTCTGTTAGCTGAGTTCAGACA11.6666666666666667No Hit
CGTCTACAACGACAAGGTCAGGCGCTGACGACGCCGGCGAGCTGCCTGCG11.6666666666666667No Hit
TGTTCATGGATGGCGCAAGACTTGCGTATGCATTAGCAGCAAAAAACAAT11.6666666666666667No Hit
GACAGATAACAATTGGTATACACTTTCCAATTCTTTATTTTCCTGTCCCA11.6666666666666667No Hit
CTTTAAAAGCATCACCTAGACGCGGGTTTAATTGCACTACAGTCCCATGG11.6666666666666667No Hit
AGTTTCAGGTTTGGGGAATTAGAGCCGTGAGTATTTGGGGAAGAGCACGG11.6666666666666667No Hit
AATCCTCACTGGGTCTTCCCCATTTCAGTAAATGGCACCACAATCCGTTC11.6666666666666667No Hit
CCTCATTTCTTGATTCGATTTGAATAACCTAAGTTACTTCTCTCTCCTTT11.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph