FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003641383

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003641383
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAACACCTGAGGCCTTCCTGGTGCCCACCAGGCACTACGGCTTCCTCTCC24.166666666666666No Hit
ATCCAATGGTGGGTGCTAACTCTTTAATAGCCTTCAGTGACTGTGAGATG24.166666666666666No Hit
GGCGTTGTGGTGGGCGTGCCAGTTCCATCCCGCCTGGGGCAGGAAGTCGC24.166666666666666No Hit
CTCCGGCCGCCTGGGCCTTACCCCCGAAAGCGTGTCGGCGCGCACCTTGG24.166666666666666No Hit
GTGTACTTCGCCGAGAAGGTGAGCTCCCTGGGGAAGGACTGGCACAAGTT12.083333333333333No Hit
CGCCCACTCGCGTTGAAGCGGCGCACCCCAATGTAGTCGAGGTAGTCGGT12.083333333333333No Hit
CGTTGGTGGCCATGCTGTGCCTCCTGCTCTCGACGCTGGTGAACGTGGTG12.083333333333333No Hit
CCCTTAGACGTCTTGGTATACGGACAACTGATGGACCCACGTTGCGAGTC12.083333333333333No Hit
GCCGCCGGGCACGTCGACCTTGTCGCCCGTGGGAGGACCCAGTTCGCCCT12.083333333333333No Hit
CCTATAATCACTGCGCCCGCTCATAAGGGGATGGCCATGGCTAGGTTTAT12.083333333333333No Hit
ACGCTGAGCCTCCTGAAGCGGGCCAAGGTGCACATCAAGAAACTGGAGGA12.083333333333333No Hit
CCGGGGTCCGGTGCGGAGTGCCCTTCGTCCTGGGAAACGGGGCGCGGCCG12.083333333333333No Hit
GATATAGAATAGACATTCCCAAGAATGGCAAGTTAAACATACAGTCGCCT12.083333333333333No Hit
GACCACCACCAGGTCCAGGTCGGAATGGTCGATGAGCTCGATGGCTGTCT12.083333333333333No Hit
GGCGAATACAGAGTTTTGCTTGGGTCCGTTGACTTCGCTCTTCTTGACGA12.083333333333333No Hit
ATATAAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTC12.083333333333333No Hit
ATGATCGCCATCGAGACGATGATTTCCCGGCTGGAGGTCGGCGAAACGCT12.083333333333333No Hit
GGTTTCCCGTGTTGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCC12.083333333333333No Hit
CATGGGAATAACGCCGCCGCATCGCCGGTCGGCATCGTTTATGGTCGGAA12.083333333333333No Hit
GTTAAGGCTGGTGTCAAGGTTCGGGGTGCCGGAATCGCGACGGTCATTCC12.083333333333333No Hit
GCCTGGTACTTCCAGCCAAACTCGTGAACCAGGCACCCCAGACAGGCAAA12.083333333333333No Hit
GCAGTGAGTCGACGCAGGGACATATTGCCAGAACTGCCGAGCACTGGGAG12.083333333333333No Hit
AGTATGGGGATAAGGGGTGTAGGTGTGCCTTGTGGTAAGAAGTGGGCTAG12.083333333333333No Hit
GTTGAGGGACCCTTATGCGCTGCGGTCAGTGCGGCACCTCATCGACAACT12.083333333333333No Hit
CGGGAATCACGTATTTCAGCATCGCGATCCGGTCGATGCCCATGCCGAAC12.083333333333333No Hit
ATATAAAACCAAGGAAAATAACCTAAAGTCTGAAAAAGACCAGAATCGAA12.083333333333333No Hit
ATTCTCAGATGTGGTGATGGTCCCCTCGTTTTTCGACGTGCCTCCCGCTG12.083333333333333No Hit
GAGGAACGACGGCTGGAAGTTGCGCTCCGCCCGAAGCGGCTGGCCGACTT12.083333333333333No Hit
GATCTGAGTAGCTGTCTTAGTGATTATACTTCCGGTATAACCCGCCAGAT12.083333333333333No Hit
GTGTAGGACTCGTCGCATTGGATGACGATGCCTAGTACTGTGCGCCAATT12.083333333333333No Hit
ACCTGTACCTGTATCAGTTCGGGTTCCGGCAATTTCAGATCGGGCAAACC12.083333333333333No Hit
CCCACAAAGGGACTATCTGGCCCTTTAATAGAAAAGGTGTGGTTGGGTGC12.083333333333333No Hit
TTTCTACTGCAGTCAGTTGATCAAGCAAGTCCATAGGGGAGCCCAGATTC12.083333333333333No Hit
GGATTTCTCTGCCTCTTCCAAACTTTTCCTCCCTGAACCTGAGGGAAACT12.083333333333333No Hit
CATGTGGGTCCACTCAGACTTGCTCTCAAAGTGCTGCCAACGTGACAAGT12.083333333333333No Hit
GCACTGACCCAGCCTTGCGCGCGGGCAAAATCGAGCCCCGTATTGATGAA12.083333333333333No Hit
GATGCCCCACTCACAAGATAGGGCCCTCCAATCAGTCTTCTGGCTCCCTT12.083333333333333No Hit
TCAGGTTGGTAACCATGACGATGGTGGCTGTGTTTTGTTCCCAGATCATC12.083333333333333No Hit
AATTATTAGTGTGCTCTGTTAATATAATTACAATGTGCAATTGCATACAT12.083333333333333No Hit
GTACATGGGGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGT12.083333333333333No Hit
TGACTGGACACTGCATCGGAAGACACTTCGTGCCGACACGAAGCAGCCTC12.083333333333333No Hit
GTGCAATGTGCTCGAAGAAGCCATGCACAACACGCTGCTCGGTGTCGAGA12.083333333333333No Hit
GCTCAAAAGGGTGTACACCGCCCTTAGACGTCTTGGTATACGGACAACTG12.083333333333333No Hit
GATCCGGACCGGATCCTCTCCGGCATGTCGGCTCGCGGCCGACGGCCGGC12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)