FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003641384

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003641384
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTAGGAAGGAGTGATGAAAACAAGGCACCAGTCCCCTTGACAGGGCCAAA24.166666666666666No Hit
GTCAAATATCAACGCTTGACAGCTGCGGTAATATTGCCGGCGCACCCGAT24.166666666666666No Hit
TGAACCGCGGCGACTTCCTGCCCCAGGCGGGATGGAACTGGCACGCCCAC24.166666666666666No Hit
GCCTATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGG12.083333333333333No Hit
CCCCGAGGGCGAACTGGGTCCTCCCACGGGCGACAAGGTCGACGTGCCCG12.083333333333333No Hit
TCTGCATCTTTTGGCAGACCGCTTGAGGCATGCTGCTTCGCAAGACCAAG12.083333333333333No Hit
GTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTC12.083333333333333No Hit
GGGATAATTGCGCGGTTTTGACTGCGGAAGGAAGCCAAGGCCCACCTAAA12.083333333333333No Hit
GGGGCATTCGTATTGCGCCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGACCGGCGCAAG12.083333333333333No Hit
CCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTCAGGCAATCCGGCCG12.083333333333333No Hit
GCTCTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAA12.083333333333333No Hit
GGCTCGCGCCGGCCGTCGGCCGCGAGCCGACATGCCGGAGAGGATCCGGT12.083333333333333No Hit
CGTGGTCGTCATACCTGTCTGGTTCATTGCCGGGCACCTTTTTGGTGCAT12.083333333333333No Hit
CTTCATATGCCTTTAATGAAAGCCAGCAATTATCCCATGGGCCCTACTTG12.083333333333333No Hit
GAATAGGACCGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGAACTGAGGCCATGAT12.083333333333333No Hit
GCCCTCGTGTTCAGCTGCTCCTTCTGGTACGTGTGCAGGATCTCCAGGAA12.083333333333333No Hit
CCACTCTACATTACGAAGGCGAACACCCGCTCCACCATTCAGAGCACCGA12.083333333333333No Hit
GAAGACCGCAAACTACTGATTCAGGCGGCCATCGTGAGAATCATGAAGAT12.083333333333333No Hit
GACTTACGGTAGGTCCGAATGGCACAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATA12.083333333333333No Hit
CTGCAGGCTGTAGTGGTCGTCCGCGTCACTGCTGCTGCCAACACTGTCCG12.083333333333333No Hit
CCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCAATTCTCAGAGGTCCCGCCGTA12.083333333333333No Hit
CGTGTTGGGCTCCCCGGTGAAAGTGGTGACACTGGAGGCTCTGCTGGGCC12.083333333333333No Hit
CCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCGAATTGGGGACATTCAAATG12.083333333333333No Hit
CAGTGCATGCAGCACTGACCGGGCCAGGCGTGGCGTTCAGAATGGCTCCC12.083333333333333No Hit
GCGGAGAGTTGGCTGTGTTACTGCCAAAATCAAGCCTTCGCCGTGCCCAT12.083333333333333No Hit
CTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGC12.083333333333333No Hit
GTCTGTCAGGCCGCGAGCGGCGTGTCAAGAACTAATTTTTCGGCACCGCC12.083333333333333No Hit
GTCCTATCCAGGCCACCTGTGAGGCTGCTTCCAAGGAGGAAAACAAGGAA12.083333333333333No Hit
TCCTTGGATCCGGCATGGTGCATCCGAACGTGTTGCGCGCGGGGGGGATC12.083333333333333No Hit
GATCGCAGCGAGGGAGCTGCTCTGCTACGTACGAAACCCCGACCCAGAAG12.083333333333333No Hit
TGGCATATCTCCAGCATCTGAGCGCAATACATATCATGCGAGCGTATTAT12.083333333333333No Hit
AGCTGGTAATGAGCAGACGCGACGTGAGCACGGGCGCACCCATTCTCACC12.083333333333333No Hit
GTTAAGTAGGGCAATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTC12.083333333333333No Hit
CTTCCGTAATCTCCCCATCGCACGGCCACGCATTACTCTCCCCGCTTACC12.083333333333333No Hit
GATCGGCTGCTCGAGCTCCGCCGCGATGATCATCGCCAGCGAAGTCTTGC12.083333333333333No Hit
CCATCGAGCTCATCGACCATTCCGACCTGGACCTGGTGGTGGTCCTGTCT12.083333333333333No Hit
AAAGAACATGAGGCCTGCTTTTCTGAGGAAGGCTGCCTGTACCAGCTTAA12.083333333333333No Hit
CCATTTCTAAACCTTTTGGTATGTGGCATTTTTCCAACACAACAACACAA12.083333333333333No Hit
GCTCTGGAGAAAATGCGCAAGGTCCGCCAGCGCTGTGGTGAGGTGTTCCG12.083333333333333No Hit
TCCCAGGCTCAGGTAATCCTCCCACCTAGGCCTCCCGAGTAGCTAGGACC12.083333333333333No Hit
ACCTCAGCCGCCGTCACCGTCGTGGGGGGGGGTGTGGGGGCGGGTGGGGG12.083333333333333No Hit
CGATGGTGATGAATCCCGCGACCGTGACCAGCGTCCCGGTCAGCATGGGA12.083333333333333No Hit
CTCCTAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGTACCACCATGCCTGACTAATTT12.083333333333333No Hit
GGTAATATATTGCTGCACTGAGTGTGTGCAATTTTTATTCAAGGTCATCG12.083333333333333No Hit
CTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCT12.083333333333333No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)