FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003642149

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003642149
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTTATCCTCATATTCTTTAAGCCCTTCACTGAAGAATGCTATGGGCTACT213.333333333333334No Hit
CTGCTTCAATCGCGGGCCACCAGGCATCAATATTATTGCGCGCCCGTGCC213.333333333333334No Hit
GTTGAGGAGGAAGATGGAGCCGCCGGTGTAGCCTTTAGCGCCGAGCGGAA16.666666666666667No Hit
CTGACAAAGCAACCTGGGTCACAGCGTGAATGAGTGCTCGCCGATTGAGC16.666666666666667No Hit
CCGACAGTGCTTGCTGCGTTTGCAGGGACGAGATATTGGTATTAAGGCTG16.666666666666667No Hit
ATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTT16.666666666666667No Hit
GATCAGGACAGAGGAAGGAATCTCTAATCGTCCCTCTCCTCCAAAACCAG16.666666666666667No Hit
CATTTCCGCTTGCATCTTTCAGCATATAATCATGACGAGGTATGCCTTTG16.666666666666667No Hit
ATTCCAGCGTTTCGACGATCTGGTTGCCGATCGTGTACAGCGGGTTGAGC16.666666666666667No Hit
GGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTT16.666666666666667No Hit
CTTGAGCACCGTCCCCTGCTCGGCAGAGATGTAGAACGCGCCCTTGCCAT16.666666666666667No Hit
GTACGCACCCAGAAAGATCGCGCCCAGCGGGCGCATCAGGAACCCGGCGC16.666666666666667No Hit
GGGCGTGCCAAACGCAAATCTGCATCCCCGCCCGTCACGGGAATACGTCA16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)