FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003642423

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003642423
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACCATGCGCAGACTCTCCTCTGACCAAATCACTCATATCCTCTTCCTGCT310.0No Hit
ACAAGGAGAAATCACAACTCTAAGTGTACAGCCTGATAGGCGGGATCTAA26.666666666666667No Hit
ATCGCTGGGCTTGTGGTGTTCACCCTGCCCGTGCACGGTGACAACCGCGG26.666666666666667No Hit
GATGTAGTCAGCGTGACCAGGAGCGTCGACGTGTGCGTAGTGGCGCTTCT26.666666666666667No Hit
GGCGTGGGAGCCTGCGCCGTGCGTCTCGATGACCGGGGCGCTCAGTGTGC13.3333333333333335No Hit
GTGGAGTTCTTGCTGTTGTCGGTTTCGCCATTATGGCCCTCGCCGTCGGA13.3333333333333335No Hit
TCTGAATGCGGTCGCTAACGCCGACTGGCTGATCGGCCAGCTCCAGCAGT13.3333333333333335No Hit
CGGCACTGGACGCCATTGTTGCGCACGCTCCCGGCGCTCTGTCCCTTCGC13.3333333333333335No Hit
CGCGCCAACTATTTTCCACCCCGCCAGGCAAATACGACCACGAGGTGACG13.3333333333333335No Hit
GTGTCAAAGGTGAGACTTGGAACTCAGCCCAGCCAGGCGTTGTGGGCGTA13.3333333333333335No Hit
GAGCAATGCGGATGCGCAGCGTTTGAGCCAAGATATTCACTTTAGCCGCG13.3333333333333335No Hit
CCAATAAGGGGGGAGCGCACCCTGTATAACTTCAGTCGGTGGATATGAGT13.3333333333333335No Hit
CGAAGGGCAGCCCACGTGCAGTGCACAAGTGCGTGACTTTGTCACGAACT13.3333333333333335No Hit
ACACATGATCCGGGGTCACGCCGCGGTTTTTTGCACCCGTAAGCACGAGA13.3333333333333335No Hit
ACATCAAGCTCGCCGGTCAGCTGCTGGACATGGGCGCTGACTCCATTGCT13.3333333333333335No Hit
GCTACATGTCCACCGATAATTCTGCTCCCACGCCACACAAATGCCTTGCG13.3333333333333335No Hit
ACCATGCGCAGACTCTCCTCTGACCAAATCTCTCATATCCTCTTCCTGCT13.3333333333333335No Hit
GTACAAGGGCATAGCCCGTGCGGGGTGTTTTGTTGGGGGCGCATTCACTC13.3333333333333335No Hit
CGTCGTCAACGTCACGGCGAATGGCGGCACGCTGACCGGTGAGATCTTGA13.3333333333333335No Hit
GCTCCAGTGCGACGAGAACTCGACCCAAGTCGCGTGCGCCTCCACCAGCT13.3333333333333335No Hit
CCCGAGACCACCCGCCTGGCCCACACCATCGAGACCTGGTGGCCGGCCAT13.3333333333333335No Hit
CCATCGCCCCTTCCTGCGGGATGATATCGCTGCCGTATAACGCATCGTAC13.3333333333333335No Hit
GGGAACCCCTTATTGCAAACGTTCTAATAAACGAGCCAGTTTTTTATTGC13.3333333333333335No Hit
CCCGACACCGCGTCCTCGACGACGACGCACTCTTCAGCAGGCACACCGAG13.3333333333333335No Hit
AGCAGGTAGAGCGGCTCCCCGGCGGCCGCCCGGACGACGGCGACGGTCAC13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)