FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003642424

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003642424
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CATTCCAGCTGCCTGAACTGCATTTTCAACCTTCCCAGTGCGTATAATGC310.0No Hit
GGCTTGCCTTGCCGGAATCTCCACCCGGTCTGTCAAAAATTTTCCCTTCA26.666666666666667No Hit
GTACTAAGCCGCACGTTAACATCGGCACCATCGGTCACGTCGACCACGGC26.666666666666667No Hit
GCGGGGGACGTAGACGGCAACGTCGGGAGTGATCGTGGAGGTGTAGACCG26.666666666666667No Hit
GCCATGATGCGCCTTCGATAGTTGTCCATGTTGCGGAACCCGCAGGCGAC13.3333333333333335No Hit
ATGGTGAATGTCTGAATTAAAGGAGCGCACATGAGCAACGTCGAGAAGAC13.3333333333333335No Hit
CTTAAACGCAATTCATCCTGCTAAGCAGCTCAGACAGAACGAGTGATCAG13.3333333333333335No Hit
GATGTTCTGTCGGCATTCTTGGACCGATGGAAGAATCGCGCCAGGGACAA13.3333333333333335No Hit
CTGTACGCCATTGCCACGGTGACAGGTACCGAACGTGACCCGCAATGCCG13.3333333333333335No Hit
AAAAGGAGCCATGCGACGGACACATGTCAAGATGGAATCATTGCCCAGGG13.3333333333333335No Hit
NATTCCAGCTGCCTGAACTGCATTTTCAACCTTCCCAGTGCGTATAATGC13.3333333333333335No Hit
ATCTGGCACCAGAAAATCGTCAGTTGCTGGCAGAACGCGATCGCATTCAG13.3333333333333335No Hit
GTGGATAGGCTGCACGAGAGTGGTATGGCGATGGCGGTGGTCTCATCGTC13.3333333333333335No Hit
CCTCCAGGTCAACCCGGCCCTGTGCGACCTCGTGGGGTACACCGAAGCCG13.3333333333333335No Hit
GATGCCACCAGTAACAGCCGGGTTTGCACATCGTTAAGCTGATGGCCATG13.3333333333333335No Hit
CTCTTGATGAGGAGGGCCGACCTGGTCTTGGATCACGACCAGCTTGTGCC13.3333333333333335No Hit
GCCCCCGGTGATCGAACCGGTGAAGGTACCGCCATTCACGATCGTGACGT13.3333333333333335No Hit
GCCCAATTCCATTCACGGTTGACATAATTGTCTGGCGCATTGACGTTGCG13.3333333333333335No Hit
ACCACCCTCGACATGCAGGCACCGATCGTGACCACCGGCAAGGGATCGCG13.3333333333333335No Hit
TCAGGTGCCCGAGGAGTTGATGGGGGCCATCCGCCACCTGGTGCGGGGCA13.3333333333333335No Hit
TGACGATGTTATAGGCGGCCTGCGGCTTAAGCAGCGCGGCCATGTCCTTG13.3333333333333335No Hit
CTGCACGACGTGCTGCGGACGTTCCGTCCCAATCCCGGTGGCGACACGCT13.3333333333333335No Hit
GGTTAGCACGAACCCCCACCCCCAGGCCACACTGGCTGGCGACCTGGTTA13.3333333333333335No Hit
TCTTCTGGTTTAGGTATATCAAGCAGCATGTCGCACGTCGACGTTGTCCA13.3333333333333335No Hit
CTCGGGGTATGTACACCTCGAGCAAAAGGAAGGACGGCGGTGGTTGGAAG13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)