FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003644031

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003644031
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTTATATAAAGCATATAAGGAAGTAAAGAATTGCTTGGCAGAACTTGATG28.333333333333332No Hit
GTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTAC14.166666666666666Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
TCATGGAGCTGGCGAGCGAGTGCTGAGCCCAGCATCCCGACCAGGGCGGC14.166666666666666No Hit
GTGATGCGGCGCGCCCCGGAACACCGCACCGACCAGTTGCCGGAGAAGGA14.166666666666666No Hit
GAATNGCGCCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGACCGGCGCAAGACGGACCAG14.166666666666666No Hit
GTTGTGGAGTGAGTGTTCAAGTCTTCGGAGTTTGGGTTTGCTTGTCCAGG14.166666666666666No Hit
GTGTAGAGCTCGAAATGCGAAGTCGCGAGTGCGGGGCGGGGCCGCAGCAA14.166666666666666No Hit
GCACGGCCCTCGGTCACGACGTCCAGCACGGAGCCCGAGAGGCCGTCCAG14.166666666666666No Hit
CCCCGAATTCCAGCAATCCTGGGCCAGGTTCCGTAACTCCGGCGGTTCGG14.166666666666666No Hit
GCATGAACCGGCCCGATCCCCATCTCGTCGGGTTCGCATCCGGCGGTCGC14.166666666666666No Hit
GCCGCCTTCCTGGAGGCCGGGATGCATGGCGAGATGGGCTGGATGGCCGA14.166666666666666No Hit
CCCCATCACAGCCCCGGCCGACCTGCGGCGTGACCTGGCCATCGCCTCGG14.166666666666666No Hit
CTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGGCAATGCAGGCTCTT14.166666666666666No Hit
TCTCCCAGCCGGTCGCGGGCGGTGATCGCCCAGACGATGGCGCGAGGCGT14.166666666666666No Hit
CCCTGGGGAGGGCGTTGCCTTCCCCGGAACCCATCCGGCAGGACCTTGCG14.166666666666666No Hit
GGCCGAGTCGGCCGCAAGGGTGAGCCGGGATCTGCTGCGCGCCGGCGGCG14.166666666666666No Hit
GTATTGCGCCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGACCGGCGCAAGACGGACCAG14.166666666666666No Hit
AAATAAAACAGGGTGTCTGGGGAAAGCTAGGGGAAAATAAGTTAGCTGCA14.166666666666666No Hit
GACCAGCGCGCCGGTGCCTTCGACCTGGAGCTGGAGGTGCTGCTCGCCAC14.166666666666666No Hit
AGCTTCTCCGCCAGGGGCGCCGCGGTCTGGAGTGCCCGCGTATAGGGGCT14.166666666666666No Hit
AGCATGAAGAGGTTACTCCTTAAATTACAGTAATTATTTCCATTCCTGCT14.166666666666666No Hit
ATTCTAATCACTTGTATATGTTTTTTCAAGGTAAACTTTTTTATAGTAGT14.166666666666666No Hit
CAGCTGGGATGTATTTACAGCTATGGTATAAAGTATTAATTTTGATGCAA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)