FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003644177

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003644177
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATCGAGGGTGGACGGCGAGTCGTGTTGGTCAATCCGGCCGATATCGAGCA413.333333333333334No Hit
GTACAAAAACGGCCCGTACACTCTCGACAAACTGGGATCGACGGGACGGG26.666666666666667No Hit
GCGCGGCGTTCCGCAGCGTCACCGAGCGGCACGGCGCGGCCGAGATCACC26.666666666666667No Hit
ATGCCACCCCGGCCGCCGCGGAGATGTCCCGATGAGTACCGCTGTGATGG26.666666666666667No Hit
CGGGGAGGTGGGGTTCGCGATCGACATAGTACCGGCGGATGACCTCGTCG26.666666666666667No Hit
GCAGGGATCAGCGCGGGTCCCCGTGGTCGTCGCGGTCCTCGCGCGCCTTG26.666666666666667No Hit
TCCTCGCCCAGCGTCACCGAGGTCAGCTCGGAGCGTCCGTTGCGCGCCAC13.3333333333333335No Hit
CGGCTGGAAGAGCTCAAAGACAACCACCCCTCAGTCGGTGATGTCCGCGG13.3333333333333335No Hit
ATAAGAGACAGCGTCGATGGGCTCGAAAAGAAACAGACCGGCATTCGTTT13.3333333333333335No Hit
GACATGAAATTCTCCAGTCGGGTTAGGTCTAAAGCCGCCTCAGACATTCT13.3333333333333335No Hit
CTTCCTGTTGCATTGGGGCTGCAACATTTGAGGTGATGTTATCTGCAAAT13.3333333333333335No Hit
ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGATTACAGGTGCTCACCAC13.3333333333333335No Hit
ACGTCGACCTGCCTCATCGAGGTCGAGGTCCCCGGAGACCCGCAGGATCC13.3333333333333335No Hit
CCCCACGAGCGCGCCAACCACGGAGAGAACGAGTGCGACGACGGAAAGGG13.3333333333333335No Hit
CGCCCTTCTTGAGGCCGGGCGCAGCTTCTTCGTTGATGAACACCACCGGC13.3333333333333335No Hit
GAGTGGCGTCATTGGCCGGCAACATCTGCCGTAAGACTTTTCCTGGAACC13.3333333333333335No Hit
GTATTGATATGGGGAGGTCGATATGGCATCCGGTTGGGCTAACGATGACG13.3333333333333335No Hit
GCTCCCACTCTTTCTGTGGGGGAGGATGTAGCTGAACTTCGAAGACGGTC13.3333333333333335No Hit
GGGCCAAAGGGGAGGCGTGTGTCTAACATGCTTGGCCTGTCTTGTTTCTC13.3333333333333335No Hit
GATATGCTCTCGGTCAACCAATCCAGCGATGCGCGTATTTGCCCGCCGTC13.3333333333333335No Hit
GGCATCATGCTTACCGGTGGTCTCGTCGCTTTGTTCATGGGCGTTGACGC13.3333333333333335No Hit
GGCCACAACCATGGGTAAATGGCACGATCACAAAATCACCGACACTAACA13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)