FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003644178

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003644178
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCACGAGCGGTTTGGTCTCCGGATAGTACGCCGCTGCTGAGCCACGAGGA413.333333333333334No Hit
GTTCGGCCTGGCGCTGCCGATCCCAGCCATCGACCAGCTCGCCCCGCGCC26.666666666666667No Hit
ACCTAGGCTGGTCGCCGTGAAGGAGTTCGTGGTCTACACCGCCCTGCGGA26.666666666666667No Hit
GGTACCACATCTTCTCCTTCCTCTTCGGCTGGTATGACACGCGTTGGGAC26.666666666666667No Hit
GCTCCAGCACGCGGTTGAGCCACGGCGCCGACACGTCGAACGTGCGCGCG26.666666666666667No Hit
ATGTTACACGTGCAAGACAGGTCAGCCATTGACGTGCAGGAAAGGAAAGT26.666666666666667No Hit
GGTCGTGTTGCCCTCCCAGATGGGATGGGACTTCGGGAAGTCGTACATCG13.3333333333333335No Hit
AGTCTGAAGAACCTGATGATGGCCTGTTTCCTACACGCGCACGACGGAAA13.3333333333333335No Hit
TCCCAACACCGCACAACGGAGTGGGCTTGATAGTGCTGGCCGTCGTAGTC13.3333333333333335No Hit
ACTGGGAACGGCGTGTCATCCAGGTTCAAGAACCCCCGTCACGCGCGGTG13.3333333333333335No Hit
GGGCTGCGCTTCGGTGTCTGGGGTGTCTGCGCGAACAGGTGCGTCTGCGG13.3333333333333335No Hit
CCTTTTCGATGACGTCGTCGGCGAGGTGGAGTGCTTGGTCGATGACGTCG13.3333333333333335No Hit
GCTTGATGCGTCAGCTCTGCCCGCGGGGGAATCTAGTGCAGCGGTGCACG13.3333333333333335No Hit
GGAGGGAGGGCGCGGATGGACGCGTTGGCCATCGTGGAGAGCGAAGTCCG13.3333333333333335No Hit
GTCACAGCAGCGTTAAAGGCACGGAATGCCACGCAAAATACAAATTATAC13.3333333333333335No Hit
CTGAAGAACTTGTCGCTGTTCAAACTGAGATCAAGAAACTCAGAGATGAA13.3333333333333335No Hit
TCTTTCTGCACGCAGGTGCCTGTAGCGCCGCGTCGTGGCTAAAGGACGAA13.3333333333333335No Hit
TATCCTCAGAGTCCACCTCTTCCTGAACAACTACTCCACGTCGTTTGGTC13.3333333333333335No Hit
GTCCTGGTCAAATGACCATTACCGAAGCACCAAAACCAACGATTGAAAAA13.3333333333333335No Hit
GCACAGGATGTGGTCAGAAAAACACCAGAAACAGGCCAGGCACAGTGGCT13.3333333333333335No Hit
GCGTCGCGTTCCGGCAAGCCGACGACGAAAACTAACAGGCACGGGAGATA13.3333333333333335No Hit
CTCGTTCGCCTGCTCGGCACGGGGCACTTCATGAATTCGATCGTCAACCT13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)