FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003644403

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003644403
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGATGTACCCTTTATCGTGATTGCCACGCCTGTCGAAGAAGTGGGGCGCT28.333333333333332No Hit
GGGAAAAATGAAAGCGGTCGTGGCCAGGACTGGCGCAGCTACCGTTTCAG28.333333333333332No Hit
CTGCTGGATGATGCTGCTCTGGCCGAGCCCGGCGCGTTGGCCGCCGGCGC14.166666666666666No Hit
CACCACGTCAACGGCTCCCGGCCCCCATGCACGGGGGAGGGAGATACCCC14.166666666666666No Hit
GAGTACATGGGGGAGGCGGAGTGAGGGGGGCTGCGTGGCAAGTGTGCCCC14.166666666666666No Hit
GGTCATCTAAATTCTCACGTATGCCGACATCGCAACGAATAGTAACTGTC14.166666666666666No Hit
CAGTATGAGAAATTAAATGCTGGGGAACAACGTTTAATGAATGAAGCCTT14.166666666666666No Hit
GCCCTCAACTGAGGACGTTTACGACTGCAGGGTGGAGCACTGGGGCTTGG14.166666666666666No Hit
GTCCAGTGAAGAGGGTTGGAGACTGTTCAAGATCGACAAGGAGTACTTGC14.166666666666666No Hit
GGAATAGGACCGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGAACTGAGGCCATGA14.166666666666666No Hit
CCTGCGCATCCTCGACGTGAAGAGCGGCAAGCCCTTGGCGGACGAGATCC14.166666666666666No Hit
CTGCAGGGTCTCGATCATCTTGCGGTAGCGGACCTTGGCGGTCTCGCGCT14.166666666666666No Hit
GGAGGTACTGGCGGGCGACGCGCTGGATGTCTGCGGGGGTGACGCGCTCC14.166666666666666No Hit
GACCATCATCACCCCAGCATTGTTGATCAGGACATGGAGAGGAATCTTCT14.166666666666666No Hit
GCTACCGGCAAGTAGGTCCAGACAAATTAGCGTGGCGCGTCTTAACCGTC14.166666666666666No Hit
GGGCCTCAGCCAGCCCTCCGGATGCTGGTGCTGCCATCCCCCTGCCCTCA14.166666666666666No Hit
GTCTGCGCCCGAGGTCGCCGCTGCCCCGGTGACGCCGGCCGCCCCAATGA14.166666666666666No Hit
TCTATTCTCTGACTACAGGGCAAATTGTGACATATCTCTTCACTGATTAC14.166666666666666No Hit
GAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAAGATGCTGCCAATAACTATGCCTGGGG14.166666666666666No Hit
GTACATGGGATCCAGAATACATTTCCAACAAGAGCACTGGCCAAGTCAGC14.166666666666666No Hit
AACATGATCTTTCTGCTCCGCTGAGAAGTACACCTTTTTGCTAGCATCTC14.166666666666666No Hit
CACTGGTAGGGCGAGGCGCCGTTGTGCGTTCTCAGGTGCTTGATCATGGC14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)