FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003645124

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003645124
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CAGATGTGCTTTGCAAAAAGCTTCATGAAAAAGTACACATGTGATTCCCT213.333333333333334No Hit
GTGTAGTACAAGAGATAGAAAGACCAGTCCTTGCTGAAAGACAAGTCTGA213.333333333333334No Hit
ACAATGTACACTGTACCCATTAAGTAATCTCCTATCATTCACCCCACTCC213.333333333333334No Hit
GCAGATATTAGTTTAGTAGTTAGAGATGACCGTCTAATCATCAAACATCG16.666666666666667No Hit
CTCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTC16.666666666666667No Hit
ACATGTAATAGCATCTGCCATTCTATCAGATGCAAAGAAACTGCTGAGAA16.666666666666667No Hit
GAGTTCCAGACCGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTGTTTTGAG16.666666666666667No Hit
ATCCCTATGAGGCATAATTATAACAAGCTCCATCTGCCTACGACAAACAG16.666666666666667No Hit
GCTAGAGGCCGCCACGCAAGTGAAGCCAGCAGAGGAGTGATAGCTGCTCC16.666666666666667No Hit
GTCTATGAGCTTTGGTGCAGGATCATTTTGGCTACTGGAAAAACCATAGC16.666666666666667No Hit
ACCTAACCAACAAACTTAAAATAAAATCCCCACTATGCACATTTTATTTC16.666666666666667No Hit
NTTTACATACAGAGCAATTAGGGTCATGAATATTCTTTCCGTCTTTTAGT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)