FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003647275

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003647275
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATTTTACTGAGTGTTAGTCCCGCCTTCCCGTCATGAAAGTAGATTCCACA34.0No Hit
GGCAGCTTGGGCTTGGTGGCCCTGCTCACACTGCTGAGGTGATTCCAGGA34.0No Hit
GGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCATTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTT22.666666666666667No Hit
ATCCAACGCTTGGTGAATTCTGCTTCACAATGATAGGAAGAGCCGACATC22.666666666666667No Hit
GCATTTTGGGAGGCAGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGCG22.666666666666667No Hit
CCCAGAAACCAGCAGCTGTGTTTTGGAATCCTTTGTGAGGATAAACAAAC22.666666666666667No Hit
CCTATGGTGGAAAAGGAAACATCTTCACATAAAAACTACACAGAAGCATT22.666666666666667No Hit
GTCTCCATCTAAAAAAAAAAAAAATATGGACGTGCAAATAACTCTTCCTG22.666666666666667No Hit
ATTCTACACCTCTCATGTCTCTTCACCGTGCCAGACTAGAGTCAAGCTCA22.666666666666667No Hit
GATACAGGGACTATGGCAATGGGGTCTTGCAGTGGGGAGTGAGATTGGGC22.666666666666667No Hit
ATTTAAAGCAATCTGCATGCCACTTTTCTTTCTCAACATTTCACAGGTCA22.666666666666667No Hit
GCTGCAGGGAGGAGAGGTGAGAAAGGAAGCGTCTTCTAGAGACATTGGCC22.666666666666667No Hit
GCAGCTGCACTTGTCCGACGCCCCTTTGCAGATGCAGCCCTGGGCACACT22.666666666666667No Hit
CCTGCCCTGTGGTCTGCTGACCCCGAAGCATGGTCAAGGTAGCAATTCTC22.666666666666667No Hit
CAGCGATAGCGATGGCGAACATGGATCAACCGTAATCGGTTGCAATCCAA11.3333333333333335No Hit
CCCTATTAGTGGGTGAACAATCCAACGCTTGGTGAATTCTGCTTCACAAT11.3333333333333335No Hit
GTATATGGTGAGAGGAAGGGGTCCCATTTTAATCTTTTGCATATGGGTAA11.3333333333333335No Hit
CTGTTAATATTAATGATAGCTATATAAAATGATACAAACACTATATTATG11.3333333333333335No Hit
CCTTATGAGAATCTAATGATAAATGTGGTGCGCTTGAATCATCGCCCCCA11.3333333333333335No Hit
GATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAGGTATCGGGTCCCATGTACCTGTCT11.3333333333333335Illumina Single End PCR Primer 1 (96% over 27bp)
ATTATTCTCTCTAGCCAAACATTCAAAAATCCAAATATTACCTTACTCCA11.3333333333333335No Hit
CATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGACCCGGGGA11.3333333333333335No Hit
GCTTTGTCAGAGGCATGTTTTGCAAATGTTTTCTCCCATTCTGTACATTG11.3333333333333335No Hit
TCTTCTATCTCAGCACATGTATCTGTTAGGCTCTTCATCATTCAAAAGGA11.3333333333333335No Hit
CATGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
CTCCATCTTCCATTTCTTTGTGTTTTTTACTCCAGACTGCAGGTTATAGC11.3333333333333335No Hit
CTCCATCTTCCATTTCTTTGTGTTGTTTACTCCAGACTGCATGTTATTGC11.3333333333333335No Hit
GTATAATTCAATCAAATAATGACCCTCCTTCATTGATATACTTTGCTCCT11.3333333333333335No Hit
GCGTTCGTCGTTCGTGGCGAACGTCACGCGGACGTGGCAGTTATCCAGAA11.3333333333333335No Hit
CAGTAGAGGGGACTGTCACTTTTTGCCTCGGACAATCCAGGTTACTTTCA11.3333333333333335No Hit
GTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGG11.3333333333333335No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGATGTACGCGACACCGAGATCTACACTCTT11.3333333333333335No Hit
GTTCGGGTTCTTGCCGCCGAGCTCAAGCGCAACCTTCTTCACGGACTTGG11.3333333333333335No Hit
CCTTTGTGTACTTAACTCCCTTGTTAGTTACCACTGCTTTTTATAAAAGT11.3333333333333335No Hit
AGGTAGCACAGTTCTCAGCAAAGAAAGTAAGTCCTTTCTTCTGCGTGAGG11.3333333333333335No Hit
CCGCGACACACCGAAGCATCCCCGTAGCGTGTCATTTGTGCAAGCCCTCC11.3333333333333335No Hit
GGAGATTCCTGTGACCCTCATCATTAAAGCACCGAATCAGAAATACAGTG11.3333333333333335No Hit
TGGCAAAGGATGTGAATGAACATTTCCCCAAGGACCATACACAAATGGCC11.3333333333333335No Hit
GTACAAAGCCTCCTTAATTGGGATGATCTCAATTAAGGGGGCTTTGTCGA11.3333333333333335No Hit
CCCCAAGTTCGACTGGCCACGTATCGACTCGCCGTACCTGGCAGACGGCC11.3333333333333335No Hit
GAGAATTGGGATACAGGACCCAAAAGGCTGAAAGGGGGCAGTGAAGTCGG11.3333333333333335No Hit
AAGTCAAAAAAACGTACGTCACGAAAGATCAGACGATTGCAGCGCTCGAC11.3333333333333335No Hit
ACGCCGAGGTTCACGGCAACGTCCACGGACTCCTTGAACTTGATGGTGGA11.3333333333333335No Hit
GTTAGATTTTTTCAAATGTTTTTTCTGAATCTATTGATCTGATCACATGA11.3333333333333335No Hit
GGACATGCGGCCGCTGTCGCTCTCGATGAGCGAGGCCACGCCGGCACCGG11.3333333333333335No Hit
CGGGCAGTGCGGGGCGGCAAGGCGACCATGGAGCTTTTGCGGACTATCAC11.3333333333333335No Hit
AGGTAGCACAGTTCTCAGCAAAGAAAGTAAGTCCTTTCTTCTGCTTGAGG11.3333333333333335No Hit
ATCATGAATTTCCCCCACATTTTCACCACGTTCTCAAAGGACTATCTGTA11.3333333333333335No Hit
ATGGGCTTCTGCGCCGCATTGGCGATGGTGCGCACGTTGAGCATGGCCTC11.3333333333333335No Hit
GGACTTCCTTCATGAATCTGGTTGCTCCTGTATTGGTTGCACATATATTT11.3333333333333335No Hit
GGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTG11.3333333333333335No Hit
GCAGCCGGCTGATGGCAAATACAGGCTATCAAAGCCCTGTCAGCACTCCT11.3333333333333335No Hit
CACCAACCCCGTGCCCACCCGCGCCGAGGTCAGCGACGTGGCCAACGCCG11.3333333333333335No Hit
CCTGTTCCGCTAACTTTTTCGCGAGCGCGGCGCGGCGGCGGTGATGGATC11.3333333333333335No Hit
CCGCAACCCCGGCAAGCGCGCACCGCTGTGGCAACAGCGCCAGCGCGCCG11.3333333333333335No Hit
ATGGAAGAAGAGAAACCTGAGGGCCACGTATGACGCCACGCCAAGGAGGG11.3333333333333335No Hit
CCCTTTCCAGCCGCGCCCCGTTTCCCAGGACGAAGGGCACTCCGCACCGG11.3333333333333335No Hit
ATGTGTGTCTCTGCACATGAGATGGGTCTCCTGAATACAGCACACTGATG11.3333333333333335No Hit
CTTTTTTACGGCTGAGAGAGAAAATCATCATTTTCTTCATCCAATCATCC11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)