FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003648336

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003648336
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAGTCCCAATGCCCTTCCAGATACTTTCTCATGGCCTCGATTCGTTTTTC310.0No Hit
GAAGGGGGAGAAGATCCTGATCGTTACACCCGTGATGCAAACGGTGATTT310.0No Hit
GTGTGTATTCGGATCGCCACATGATTTTCCGTTCCCCTAACGAGAAGCAA310.0No Hit
GTGGTGCAGGGCTCGTTTTGATGATTGGTTTGGATGTTTTTCACGGTCAG26.666666666666667No Hit
ATATGATTCGAACGATATCTCGCTAGACGGCGATCTTCATATGGCATTTT26.666666666666667No Hit
GTTCCGGTTGATCCAGAAGGTTGCGGAAAAGGGGCGCGAAACTTTCGCCC26.666666666666667No Hit
AATGACAACAAAGGAAATCGCTGCATCCATTCACCACCGTCTGTCCCATC26.666666666666667No Hit
ACCGACGGCACCGACAAAAAGCGAAATAAAACATCTTGTCATCGTTGGTT13.3333333333333335No Hit
ATGGAACGTTGAGAGAGGCGGTACTGACGGTGTGGCCGAATCGGCCGGTG13.3333333333333335No Hit
GAGTGATCAAACGGACGACCTCTCGGCGAACGACGCCTCTGGCCCGTTTC13.3333333333333335No Hit
GTCATCTCCGTTTCAATAAAACCAGGGGCCACCGCATTTACCGTTATATG13.3333333333333335No Hit
GTTGTTAATGATGCTATTTTTTCGGCCAGACGAATTGCCGGTTCATGACT13.3333333333333335No Hit
TGCCCGTAGCGGGAAAGATTTAATCGGCCAGGCGCAGACCGGAACCGGTA13.3333333333333335No Hit
GCAGCTTCCTGAAACGGAATAGCTTCTCCATACCACGGGGTATTCACCAT13.3333333333333335No Hit
ATGGAACGTTGAGAGAGGCGGTACTGACGGTGTGGCCAAATCGGCCGGTG13.3333333333333335No Hit
GCCCGTGCTTTCTCGCGCGCCAGACGCACAACATACTGCTGCGCGCTCTC13.3333333333333335No Hit
GGTGGAAATCATTCATGAATTTAAAGAAAAACCGCTTCAAGCAGATGACG13.3333333333333335No Hit
GCAAAATCGAGTCGAACTGCCGTATGACAGTGTGGCAAAAGCCAGGCTTG13.3333333333333335No Hit
TGGTTAAAGATAACTGAATTCCGTGTTGACGTAAAGTTTTCAGCTCATCA13.3333333333333335No Hit
GAAAAGGCTTTTGAAAAAGCAATTCGTAGCTGTTTTCGGGAATTTATTCG13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)