FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003650931

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003650931
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACGCCGCCGATGTCGGTGACCATCGTGACGACGGTCTCGCCGCGCGCGAT36.25No Hit
GTATCGTTCCGCCTGGGCGGGATTCTGACTTAGAGGCGTTCAGTCATAAT36.25No Hit
GTTGCCCGGCGTGCTGGCGGTGGCCGCACCCAGCCGCCGCCAACCCACCT24.166666666666666No Hit
GTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGAT24.166666666666666No Hit
GTCGGCCAGCGCGCGGATGTCGCAGACCTCGGTCAGCGGATTGGTCGGCG24.166666666666666No Hit
GGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATAAGTTCATGTCCTTTGTAGGGA24.166666666666666No Hit
CCCCTGAGCGGGGCGAGTGCGGCCACGACGAGGCATCGATGGCGATCGGA24.166666666666666No Hit
AGAAAGTACAGGCCGTCGGGCGAGAAGGTGGGCGCGGCGGCATCGCGGGA24.166666666666666No Hit
TGCCCGGCGCATGCCCGAAACCGCCGAGGCACAGGCGGTTTACGAGGCAC24.166666666666666No Hit
ATCTAAAGCTAAGCTTTACTTAGGCTTTCAAATTGTAAGCAAATGCAAAA12.083333333333333No Hit
GTAACTGGGATTACAGTCACCTGCCAACACACTCGGCTGATTTTTGTATT12.083333333333333No Hit
CGTCAACGTGGTTCAGGAAATCACCAACCTGATCAAGGCACAGCGCGCAT12.083333333333333No Hit
GTTCCTGGGCTTGTCAGAAAGTAAGATTGTTTTACTTGCTGCACATCAGG12.083333333333333No Hit
CACCGGCCTTGATCAATGCTTCAATCTGATGGGCGGTCATATCGAAATCG12.083333333333333No Hit
ATTGGAGACTTTGCCATGAATAGGGAAACTGCGGCCCACAGAGGTGAAAC12.083333333333333No Hit
GCGGGACCGGTCCTAGAGGGCGACCGCGGCGGGGTTGACGTCGACGATCC12.083333333333333No Hit
ACTTTAGCTTTTAATAGAACTTTGGGTGGATTTATTACGCCATACATATA12.083333333333333No Hit
GTATTTAAGCGTTTCCAAAACATCGGCCAGATGGGCGGAACAAAGCTTGT12.083333333333333No Hit
GTTCAGAAAGCGCTCCAAATGTCCACTTCCAGATACTCCAAAAAGAGTGT12.083333333333333No Hit
CTGTTGTAGCCTGGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCGCTGCAA12.083333333333333No Hit
CGGATATCTCGATTAATCTTTCCCGGTCCTGACGCTGTCTTGTGTCGGAC12.083333333333333No Hit
GTTTATCAACAAGCCGATCGAACGCGCCAAGCTGCTTGATACCATTCGCG12.083333333333333No Hit
AAAAACCACCGTATGGTGGGAGACGAGACATGTTGGCAGCAATGCTGCCT12.083333333333333No Hit
GAATACAAACATCACAAAATAGTTTCCGAGAATGCTTCTGTTTAGTTTTT12.083333333333333No Hit
GCACTGTCCCCGGAGCGGGCCGCGCGCCGGGCCGGCGCGACCCCCTCCGG12.083333333333333No Hit
GAAGACTCATCTGGGGAATTTTCGGGAGTAGAGGCCGGGGCTTCGACATC12.083333333333333No Hit
GGTCAGTATCATCCCCACTTTACAAAGGAGGCTCCTTAACTGGGCTCAGG12.083333333333333No Hit
CTGTTGGACCAGGGTCCTACATTAGGGCATCATTCAACCCTAATTACCTC12.083333333333333No Hit
ACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAAT12.083333333333333No Hit
GTTATGTGCATCCTTTTCCGGTAGACGGAGAACAGCTCACCAAAGGCAAC12.083333333333333No Hit
TTCTGACACCTCCTGCTTAAAACCCAAAAGGTCAGAAGGATCGTGAGGCC12.083333333333333No Hit
ACAGGCTTGTGTGAAGACGGTGTTGCCCATGCCTGTATTTGCTCGCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTGGTTGATGTGCATCCGGTGATGGTGTCGCTGAGGTGAGGAGCCTGA12.083333333333333No Hit
TGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTGATTCCCCG12.083333333333333No Hit
GAAATCTGAATGTGATTAACAGGCATTTATTCCTCCTGGAATTCCTGCCT12.083333333333333No Hit
GTCTTCCAGCCCGGCGTGAACGAGGAGCTCGCCGCCACCGCGCTGTGGGG12.083333333333333No Hit
TGGTAGCCGAATCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTGATTCCCCG12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)