FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003658246

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003658246
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC60

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCCAGCGCCGCGCGCCTTTCGGCAGCATTCCGGTTAACAAGGCGCGCGC34.0No Hit
ATCGTAAATCGTTGCAGATCTTGGAGATCTTCGCTGCTAGGCGTTTGATA22.666666666666667No Hit
GCCAGTGCGTCGCGTTGCGGACCGGCTGAGTTAAAGGTGATGGTCCCTGA22.666666666666667No Hit
CTACGACCACGCGCAGCGGCGCGTCGCCGAGCTCGAGGCGCTCGCGGCCA22.666666666666667No Hit
GCCTGCGGCTCGGTTGCGACGACGAATACGTGTACATTACGGTATGGGAC22.666666666666667No Hit
ACTTTTGACATGGGAACAGTAGAAACATTGGGAAAATTGGACTTTCAGGT22.666666666666667No Hit
CTGCCGAATGCCGTTATCCTGTGGACTCGCGTCACCCAGAAACCCACCTG22.666666666666667No Hit
ATACAGAGAAGTGCTTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAGCCAAGGCTCA22.666666666666667No Hit
CGTAGTTGCCATGCTGTCCGGAAAAATTGTCATGCAGGGCAGTGCCTCGG22.666666666666667No Hit
TCTCATAACAATGATAGGAGTCCCTCAGAAGGGAGATCCATACCATACCA22.666666666666667No Hit
GAAGAAGCGCACCGGGTTGAGCCCGTGCGCCAGCAGCAGGCCACCGTAGG22.666666666666667No Hit
ATCGTGTGCACCTCGCCGGCGAGCTCGGCGAGCACCGCCGCCTGGTAGCC22.666666666666667No Hit
CCCTTGGAATAGGCGGCGCCCGACACCATCCCGGCGGCGTTCAGATCCGC22.666666666666667No Hit
CATGGATGCCGACCAATACTCGTCATGGCTGATGAATACGAGGCCTCGAT22.666666666666667No Hit
ATATGGCTGCTTGGCCAGACTTGCAATGTAATCATCTGGGTCAAAAGCTC22.666666666666667No Hit
CAGCCCGGACAGCACAATCGCACCATTGACGATGGAGTCGTTGTTCGTGA22.666666666666667No Hit
TATCAACCCTGATGCAAACAGGGGTTTGGCCGGCGGGCTGCCGGCGGAAA11.3333333333333335No Hit
GATTTGGACGCAATAAGGTCATGCCTTTTTCAGAACGGTGACACGTTCTG11.3333333333333335No Hit
CCCCAACCCCGGCCTCGAGGTCGGCGTCCTGCTCGACGCCTCCGCGCAGC11.3333333333333335No Hit
GCTCGGGGTCGTCGTGGCTGCGCAGCGCGACCAGCGTGCTGACGAGCGCG11.3333333333333335No Hit
GAAGCTCACGATGTCGCCGGACAGGGGCAAGGCGATATGCAGCAGGCCCA11.3333333333333335No Hit
ATCCTGAATTAGCATCATAGATATTGAAGATGGCATAAGCTAATGTTGCC11.3333333333333335No Hit
CCCGACGACGGGGCATTCGGCCCCGTGGGGCGGCGCGTCGCGGCGCCGGG11.3333333333333335No Hit
ACCACGTTCCGCAACTTCAGCGAGATGCTGGCGCACAGCGACGAGAACCC11.3333333333333335No Hit
CACTTAGAGGTCTGGTGGAGGAAAAGGAACTGCACAGAAGAAAAGGAGGA11.3333333333333335No Hit
TGACCAGAGGTCACTTTTGTTGCCATCTTGGTTTTGGTGGGTTTTGGCCA11.3333333333333335No Hit
CTACACCATCGGGCGCACGCTGCTGGTGCTGATGGCGGAGTTCCGGGGCT11.3333333333333335No Hit
TAAGTGAGGTTTGCAGGCGGATGGTCTTGTGTTTAGGTAGACCGATTTCT11.3333333333333335No Hit
GGTGGCCAACGGGCTCATGGCGTTGCGCGAGGTGACCCGCAAGGCGGTCA11.3333333333333335No Hit
CACTAATGACCTGGCCGAGACGGATCGGCGTTGCGTCCTGCAGGTGGGTG11.3333333333333335No Hit
GCGGGAGATCGCGGCGGCCGTGCAGTGGGTGCTCGACAACCCGGACGCGG11.3333333333333335No Hit
GATGAGGCGGGCCGCGCGGCACTCGCCGAAGACCTGATGTCGCCGTGCAC11.3333333333333335No Hit
GGATGATTGATCTGGTCATTGACCAGCTCCTCGACCGTCTCAAGATCCAA11.3333333333333335No Hit
GTCTACACAGCCAGAGGAGCTGCTGTGCCCGGTGCTTCTGGTTCGCTTTC11.3333333333333335No Hit
CAAGGTGCACTTCGAGCTCGTGTCCTTTGGTCTGCTTGGCGTAGTGCCGC11.3333333333333335No Hit
ACCCCGGTCCATTTGCCCGCCCACGCCGCATAGCGATGCGTAGCGGCGGC11.3333333333333335No Hit
GCGTCGCCCTACCTGGCCGGCTGGATCATCGCGCGCGCCGAGGGCGTCGA11.3333333333333335No Hit
CTTCTCAGGCTTTGTTGTTCCCGGTTTTGGAGGTTCAAACCAGCTTTGCA11.3333333333333335No Hit
GAACACGACCTCATCCCGGAGGAAAGGCTGGACGAGATCATGTCGACCCA11.3333333333333335No Hit
CCGCCTAAGAGTCCGAGGGAGATCGCCGTCGTCAAGATCATGGCGATGGT11.3333333333333335No Hit
CAAGTACCGCCTGCGCTACCCCGACGCGGCCGCGCGCCGCGCGCCCTTCG11.3333333333333335No Hit
GACTTTCCTGTGAGTTGGAAGAGAAGTCGTAGCACGCAACCGAGGTTGCT11.3333333333333335No Hit
AAGATGTACTTTCCGATCCTCGTCGTCCCGGTATCGTCCATCTCGACCGC11.3333333333333335No Hit
ACCATACTCGCGGCGCTTGGCGTCGTAGTCGTCCTCGGACATGATGCTGA11.3333333333333335No Hit
CGCCGACCCTGAGAGCGTGCCAGGGCCGGCAGCATTCATCTGCGCGAATC11.3333333333333335No Hit
CTCTTAGAGGAGGTAGGAAGTTGAAGAAGTTGATGATGTTGGCGGCGCTG11.3333333333333335No Hit
CTGGCCGGCGGGGGAGCCGGACGCCGGGTCGCCATCCTCGATTGCAACCT11.3333333333333335No Hit
CGCGAGGAAGAAACCGCCCGGTTCTATTGCTCGCCGTATGTGCGTACTCG11.3333333333333335No Hit
CTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAA11.3333333333333335No Hit
GTTCAAAGGTGATCGACTTGATGCCGCCCGGGAAGCCGGAGTGGCGGTAG11.3333333333333335No Hit
GTGTCCCCACACTTCTACAACACCCCGGAGGACATCGCTCGCTTCGCCGA11.3333333333333335No Hit
TAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAACTGGGTGGAGCCCACCACAG11.3333333333333335No Hit
AGCAGAAGGTGGTCATCGCCCGCGAGCTCAGCCGCAGCCTCAAGCTGTTC11.3333333333333335No Hit
GCTCGAGGACCGCGAGCCCTGCCTGATCGAGCGCGGCGCGCGCCGGAACG11.3333333333333335No Hit
GTGCGCAACCCGACGCAGCGCGGCATGCCGCGGCCGATGGGCGCGGCGGC11.3333333333333335No Hit
GCCGTGGTTCTGGAGGATGACGAGGATGACCTTGAGGTCCTCGGCCACGA11.3333333333333335No Hit
CTTTCGAGGGCGTCGGTAGGGATACCGTTGTCCTTCATGAACTTGTAGAG11.3333333333333335No Hit
GTCTAAGGGGGCGATAAGAAATGGCTCGTTACATCGGTCCTACCTGCAAG11.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)