FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003658802

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003658802
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC65

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCGCCGGCCACGACCTGCGTCCGCAGGACAAGCTCTGGACCGGCCGCGT28.333333333333332No Hit
GAGGAAGAAGGTGACGTGCGGGTACTTCTCCGTCTCGGCGAGGCGGAACT28.333333333333332No Hit
CCGGAGTATGGCCGTGATGCCTCCAAGACGGCTCTGATGAGGTTGGTCTG28.333333333333332No Hit
CACATCGCCAAGCAAGCCGACATCTCCAAGGCCGCGGCCACTCGTGCTCT28.333333333333332No Hit
AGCATATTGACCACGCGCTGTAGTTGGGGTGAGTAGACGTCATAGCCGAC28.333333333333332No Hit
GAGGTAGACGACGCGGCCGCAGGCGGGACAGCGCTGGTTGCCGTCGGCGA14.166666666666666No Hit
AAGTCGTTCCGCAACGAGATCACGCCTGGGAACTTCATCTTCCGTACCCG14.166666666666666No Hit
TAGCGCAGCTGCTGCGGGTCGATCGTGCCCGCGATGCGCTCGGGGAAGCG14.166666666666666No Hit
ATGCCGGGACGGTGAATGTGGGAGTAGGGCTGCGAGTTGCAGGCGTCAAT14.166666666666666No Hit
AGATCGTGGTCGTGAAGGTCAGGCTGCCCGCGGCGACCGCCAGCCGGTCG14.166666666666666No Hit
CGCTGACACCGATCTCGTCACCCCACACGGGCAATCGGTCGACCAGACTA14.166666666666666No Hit
GCTGTTCCACCCGGACCACCAGCCCGGTCCTGTCGGCCGACAGCACCTGG14.166666666666666No Hit
TGTTTGGTCCGTCCGGATGAAGCTAGCATACAGGATGAGACAGAACGTGT14.166666666666666No Hit
GACGAAGGAACGGATGCCCGGGGTGTCGATGATCCAGCCCTCGGCGTCGG14.166666666666666No Hit
ACCGTGTACTTCGGTTAGTCCAATAAGGGCTAATAGACGAGTAGGCCGGG14.166666666666666No Hit
ATGTGAGGATGGGCCTCTCTTTCTTGGTGACGGCTCTCTGGCAGGAGCAC14.166666666666666No Hit
TTGTCGAAGAACGCCTGCATGCCGGCCTGTGCCTCGTCCCCCACGCGCAG14.166666666666666No Hit
TATCGAAGCTGACCATGAGGCCAATGATGATAGCGAGGACGGTTATCGAC14.166666666666666No Hit
CGCCCCGCTCCACTTCCCCGCGGTGCTCGAGGCGACCCGCGGGCACGGGG14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)