FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003660646

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003660646
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAGCAAAGCCTTGAATAGATTTTGCGTGATAGAAATGTAACCAAGAGTCC312.5No Hit
ATGGAGAAGAGTCTGAGACATGTGGAGCGTGCCGTGCGCCATCTCACCGT28.333333333333332No Hit
CGGCCATACGGTGCACGTCTTCACGCTTCTTGACTGCAGCACCCTTGCCT28.333333333333332No Hit
TACGTACAGCCTGACCATCAATTGCAGGGTCTGTGGTCCGACATCCATGC14.166666666666666No Hit
CTACTGATGGCACCAAAATGAATCAATGACCTCTGGCAAGAAGAGCTTAT14.166666666666666No Hit
ATTTAAACAATGCGTTCAAGAAGGCGCGGATTTAGCTAACCGCGCGGAAA14.166666666666666No Hit
CGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAGCGCCATCTGATCGTTGGCAACCAGC14.166666666666666No Hit
ATTAACCAGTGAGGCCCTTCGCTTCCCGGATTCCCTATTGGACCTGGCAA14.166666666666666No Hit
GGGCAGGGAGTCGAGGTAGCGAGACTCGAAAGCAGCAAGAGCTTTAGCGG14.166666666666666No Hit
CTACTGATGGCACCAAAATGAATCAATGACCTCTGGCAAGAAGAGCTTAG14.166666666666666No Hit
GATGCTCACCACGCCGTGGCCGCTCGTGGCGAGCCACAGGTGGCCATCGC14.166666666666666No Hit
ACCAGATCTTGCTGGCCGAACCGCCGTAGCAATAGACGATGACCTGCTCG14.166666666666666No Hit
GCTGGGCCATCGGCGCGATCTCACACGCACACAGGCACTCGACTTCCGTC14.166666666666666No Hit
CCCGTCGGCGGTGCGGACCGTCAACCGGTCGTCGCTCCCCGGGCGGATGA14.166666666666666No Hit
TCGCTCACCGCCGCGCCGGCCTCGGCCGCGATCAACGCGGCGGCGGCGAT14.166666666666666No Hit
CTGTTCCCACCGCAGATCGAGGCCCGAATTAGACGCGCCTGCACCGGGAC14.166666666666666No Hit
GGACAAGGGAACCTGTCAGAGTTTAAGTACTATGGCTAGCGACATCGCAG14.166666666666666No Hit
GGTTCGGCATGTTCCACCGCCACCGTTTTACCCTCGGCAAACATCTGACA14.166666666666666No Hit
GGTCGACTCGGTGGGGGCCGCTGAGCGTGCGTCCGGCAGCGGCGTCGCGT14.166666666666666No Hit
ATCTACGGTTACCCTGTCGCTGAGGCTGCTGCTACCAACGAGGGCCAGTG14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)