FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003665359

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003665359
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTGCAAAAGCCTCCATAGCCACCTCCACCAAATCTGCTGCTGCTGCCGTG14.166666666666666No Hit
GGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTC14.166666666666666No Hit
TGACGTGGCTGTTGGTGTCGTTGCGTAGCCCGGAGGCGCTGACGACCGAT14.166666666666666No Hit
AATCAGTTGCTGCATCTGGCTTTCCATTAGCACGGCAGCGCGGTGCAAAA14.166666666666666No Hit
GTATGCTGGTGATACGCAACAAAAAGCCCTACGTTTTTGAAGCGGTCGGC14.166666666666666No Hit
AGTTCCTCGTCATCGATTTCGTCATCCGCCCATTCTTCTTGCTCCTCCCC14.166666666666666No Hit
GGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCAGGAAGCTCCCTCGTGCGCTC14.166666666666666No Hit
TCTGGAAACTGGTTGGCGGGAAGAAATCGTTGCCGTGGTCCCAGTGCTCG14.166666666666666No Hit
ACTGGGTGCTGCTTTTCTCCCTGTTTCACCATCTTCCTTGGCCTCATTCC14.166666666666666No Hit
CGCCAGCACCGCGTCCAGGTCCATTTCTTCCAGCGCGTGCTGTTGGTACT14.166666666666666No Hit
GCTCGGCGTCGGGCTCCCAGCCCTCGTGGAACCCCCGGCTTCGCGCACCC14.166666666666666No Hit
GTGTAATGACAGGCTTCAGCTTGCCTTTCATTATATTCTCTTTATGGGAA14.166666666666666No Hit
GAACCCACACGGTGCGCGATCTCATCAAGCGCGGCGAGTTTGGCGGCCTC14.166666666666666No Hit
GACCCTCAACATGTCGTTAATGTTGTCGGCCAGAAGTGGTCGTGGACTTT14.166666666666666No Hit
ATTCCGGACAGCTGCACGTCATCCAGATCGTCACCGCTCATCTGTCCGGA14.166666666666666No Hit
GTTCTCAAGCTGCCTTTGGCGCTTGTTCTTCCCTGACGAGGTCTTGAAAA14.166666666666666No Hit
CTTTGGTGGTGGGTTTGAACGAGATGCTCACAATGCTGGCCTGTCGTCTT14.166666666666666No Hit
GGTAGCGAGTGTTGCTATGGAGTCCAGCGCCATTGACGACCACGAGGTCC14.166666666666666No Hit
GTATTTGCTGTTCTTCTTGCTGCGCGATGGCCCGGAACTGGTGCGCAAGG14.166666666666666No Hit
AGGCAATCAACTCCATCGCGCGAGTAATCTTCTTCGTCGTTGCGACGGAG14.166666666666666No Hit
GCTTTACACCGAGATTCTTCGCCTGTTGAGCTACGTTCAGCGCAACTAAG14.166666666666666No Hit
GCCCAAGGTCACGGAGACGATAGTGCAGACGATGCACAGTGCCAGGCCAC14.166666666666666No Hit
GTCGTCGAGCCCGGCGACGGCGAGCTGACCGTCGACGTCGTCCTCGCCCC14.166666666666666No Hit
ACTGGAAACTGGATGGCGGGAAGAAATCGTTGCCGTGGTCCCAGTGCTCG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)