FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003665360

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003665360
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTC28.333333333333332No Hit
GCTCCGAGCAGGACGCAGAGGTCGTGGGCCACGACACGACGGTGGCCGAC14.166666666666666No Hit
TAGCATGCATGAATCGTGCATAAATTTCTTGTCGAGCCCGCAAATTAGCC14.166666666666666No Hit
GCCTCAGTTGCTCTGGACAACAACGACTCAACGGCGTCCTCGCCGCGCAG14.166666666666666No Hit
GCGGAATATTTTTGCCGTAGCGTTCTTTGAGCTTAGCCTGGACCAGCGGG14.166666666666666No Hit
GTCGAGCACCACCTTGGTCGGCGATGTGGTGAAGAACGGCCGTCGCGGCT14.166666666666666No Hit
GCATGATCCGCTAAGGCTGGCGTCGGCCTATGCCAACATCATGGGGGTCC14.166666666666666No Hit
ACTGTAATGAGTTTAAGACACAAAGACAGCTAAGGAAATGTGGTTGATCA14.166666666666666No Hit
GCCGGGATCGCGCGAAGCGGCGCACAATCCCCGCCCATGAGCGACTCCCG14.166666666666666No Hit
GTCGATGGCTATGCCAAGGTTGAAGACCGGGTTGAAGAACTACGCGGAAA14.166666666666666No Hit
CCGCTCCAATGCCTGGATCCGCCTGAGAGGAGAAAGATCCTGAGTTCCCC14.166666666666666No Hit
CGGCTGCTGCCTTTGAAGAGGTCAAGAAGGGATTCAAGACCTCTGATGGA14.166666666666666No Hit
GGTCCTGAGCCATGGTGCCACGAGCCCCGTCGGCAGTGGCCATGTTTTCA14.166666666666666No Hit
GATAACATCAGCGGACTTGAGGCGGAAGCGCACTGACTGGCTCACCGGAA14.166666666666666No Hit
GTCGAGCACCACCTTGGTCGGCGAAGTGGTGAAGAACGGCCGTCGCGGCT14.166666666666666No Hit
GACTATGACTGTCCCCTCCTGCACGTGCAGGAGTTCTCGGGTGCCGTCGC14.166666666666666No Hit
ACGAAATCCTCTTCCTCGACCAGTTCAACATTCCAGCCCTCGAAATCCTC14.166666666666666No Hit
TCTACCCTCCGACTTATGTCCAGGGCTTCTTTATTTTTCTGCTTCTCCCT14.166666666666666No Hit
ATCCAGAAGGGCTGATGCCTGCCCATATGCAAAAGGGAACCCGAGGGTTC14.166666666666666No Hit
GGCCTTGCCAATGCTGGAACAACCGGTAGCGGCAGGTGAGATGTCGCCCG14.166666666666666No Hit
CCAGAAGATCAACCCGCCCAGCGCGCCCTGGGTCACGGCCACCAGCACGT14.166666666666666No Hit
GCCCCCACAGCGAGTCGGTACGCCATCGGTCGGCCCGGGGAGTCGGGCGC14.166666666666666No Hit
GGGTAGTAATTGTGGACGTTCTAAGAGTGGCAGATTTAGTGGAGGATTTG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)