FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003668835

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003668835
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC59

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGATAGGGTAGTTTGGATTGCTGGATACAGTGAGGCAAGACCTATAAAGC24.166666666666666No Hit
CGCTGGAGCTGTACACCAAGATGGTCACCGAGAAGCCCGCGCAACTCGTG24.166666666666666No Hit
GCTCAGCGCGGTGCGCGAGCGACTGGGCAGCGGCAGCATGAATACGATCC24.166666666666666No Hit
AAAAACCGGCTGGCTGGCGGTCGACCTTTGGGTAGATCACATGCTGTCTC24.166666666666666No Hit
CTTCTACTACCAGAGCAAAACCGACGCCGAAGTGAAAGAGGCGTCGGAGG12.083333333333333No Hit
GACTTTACAAACAGAGTTTCTCCTAACTGCTCTATGAAAAGAAAGGTTGA12.083333333333333No Hit
GTCCACGACATACCGGCCGCCTGGAGGCAGAAGTTCGGCATTCGGGAGGG12.083333333333333No Hit
GAATTTCAGTTGCGCATTGACGGCGAGCTATGGACGGTGCCCGAGTGGGA12.083333333333333No Hit
GGCCAAGGGTGAAGACATCACCATCGTCATGGGCGTGAACCATGAGAAGT12.083333333333333No Hit
GGACCTCGGCGCCCTCGGGCGAGATCGCCCCGAAGCGCACGAGCTGCTCC12.083333333333333No Hit
AGGCCGTGCACCGGTTCCTGGCCCAGGCCGGGCTGCCGGAGCCCGCCCAG12.083333333333333No Hit
TCGTACACCTGCCGGATGAAGTCCTTTTGGAAGTCGGCGAGCACCAGCGG12.083333333333333No Hit
ATGTGAAAGCGCGTGGCCGGCAGCGCATAGAGCAGCACCAGCGACAAGCC12.083333333333333No Hit
CTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTATTCTATGCCTATCGCGTATG12.083333333333333No Hit
TCTCGCAGCGAATACCACCGGTCCAGTAGGTGACGACCGGCTTGTCCTTA12.083333333333333No Hit
AGTCGCAGGAAGAGCTGGAGCAAGCCTCCGAGCAGATCGAAGAAGATCTT12.083333333333333No Hit
CGTCCGTCACGCACGGCAGCGTCTCGGGCGACATCCCGGCCATCAGCGAA12.083333333333333No Hit
GCTAACGGACCATCGGCCATTTTTGCCGGATCTTACGGCTGGCGCTCTTC12.083333333333333No Hit
GTTCGTAGCCTCGCCCTCCTCGTTGTCGATGAACCCTCGTCCCAGTCCCC12.083333333333333No Hit
CCGATTTGTCGCGCGTCAGAAGCTCCCCCAAACGAGAGGGAAGTTCTGCC12.083333333333333No Hit
GTTTGGCGCCGAGCGGTCGCCGCGTGCGTACCGCCGCGGCCGAGCGGGCG12.083333333333333No Hit
CTACGCTTCTTGGGGGCAACGCCTGAGGATCAGGTGCAGCACTGGAAGCA12.083333333333333No Hit
CTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCG12.083333333333333No Hit
ACTGCGATCATTTAGATTATTGTCTCCAAATACCTTATTGTAAATAAAGA12.083333333333333No Hit
CGACGAGCCGGTGGCCGGCATGTCGGATGCCGAGACCGAGCGCTGTCTCT12.083333333333333No Hit
CACCAGAGCCAACCAACTGGCGGAACTGGCCCATCAGCGCACCCGCCTGG12.083333333333333No Hit
CCTTCATACACATCCTCGGCTAGTTCCATCTGGCATTTCGCGCACCACAA12.083333333333333No Hit
GCCGATTTGAGTGCGCTCGCGGCGGTGGATGCCTACCGCGGGCTCACAGA12.083333333333333No Hit
GATTGCCACCGGCATGTCGCCCGACGTGTCAAGCGCGAACATCGACCGGG12.083333333333333No Hit
CTTTTCTTTCGGGAAAAGTAGGCAAAACCATTTGTCAGTCGCAAACTCGG12.083333333333333No Hit
ATGGCGGCCTTGGTCACGCGGGCATCGCCGTTGGCGTACAGGATATCGCC12.083333333333333No Hit
CGGTGCACCTGCGCGAGACGCATCTCAGCGGTCCGCGAAGGCGGCTGGCG12.083333333333333No Hit
TCGAGTGGGTCGCCTGGCTGCTGCTGATGTGCGGCCTGGTCGTGGCCGCG12.083333333333333No Hit
GCGAGATGACGGGTCTGGACCTGGGGAGCGACCTGCTGATCGAGGTGGCG12.083333333333333No Hit
ACGCTGACGCGGCTTCTTGCCGATATCTGGCGTATCGACCCGCGCGAGCT12.083333333333333No Hit
GTGGTTTCCTATAAGGAATTGACAACTTTTCGCGAGGTTGACATCTCGCT12.083333333333333No Hit
GAATAGTAGGCCGCTTCAAACATCGAAAACGCCACCATCGCCGAAATTAA12.083333333333333No Hit
GTGCATGTCTGCGGCGGCGGCGCCTTCAACATGCATTTGCTGAATGAATT12.083333333333333No Hit
GGCTCGATGGATTCCCCCACCAGCGTTGAACGTCTTGCCGGGTATAAAGA12.083333333333333No Hit
CGAGCTGGGTGTTGGTACGTTTCCCACCTACTGGCAGGGCAAGACGGTGA12.083333333333333No Hit
GTGGGAGGATCACTTGAGTCCAGGGGTTTGAGATCAGCCTGGGCAACATA12.083333333333333No Hit
GTCGGTGGCCGTGGCTTGCTGGCGCAGCGTGGCCGTGCGCACGGTGGCGG12.083333333333333No Hit
CGGCGAGTAGCCGCAATCGCCGATCACGGTGATGTCGCCGCCGATCAGCA12.083333333333333No Hit
GGCCGATGCCCACGAAGTCCAGCAGTTGCTGCGACTTGGCGCGGATCGCC12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)