FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003668836

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003668836
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTCGCCGAACGGCACGAGGTGGTGCTTGTTGTAGCGGTACACGCCCTGGA24.166666666666666No Hit
CATGTGATCTACCCAAAGGTCGACCGCCAGCCAGCCGGTTTTTCTGTCTC24.166666666666666No Hit
AAAGTAAAGTTGAAATTACTTTTTTGTCCTGGAAACTTTCCGATCTATGT24.166666666666666No Hit
CGCCGGTGCTGGCCAGCATCGCGTTTTCACTCATGACCTGCGCCAGGGCG24.166666666666666No Hit
CTGCCGAGCAGCACGTAGACGCTGCTGCCGAGCGCCTGATAGAGTTCACG12.083333333333333No Hit
TCGCCGGCCAGTGCGGCAGCAGCGGCCGATGCCGCCGAACGCGGTGCAGC12.083333333333333No Hit
GGCCTACCTCACTGACTTGGAACGCGCACGTGAGCAAGCGTCAGACCTTC12.083333333333333No Hit
AACCAGAGCGCAGCGGCGCAGCCGATGCCGTCCGTCTCCCTCTCGGGCCT12.083333333333333No Hit
GGCCTGTATTGCCGCATTGATCGCCCGGCGTACCGGCCGCGCCGCGCGCC12.083333333333333No Hit
TCTCTCGGAGATCAAGAGCGGGTCGAACCAGCGGTTGACCGACTTTCTCG12.083333333333333No Hit
CGCTCGGTCTCGGCATCCGACATGCCGGCCACCGGCTCGTCGCTGTCTCT12.083333333333333No Hit
ATGGTGGCCAGCGCGTTCGAGAAGGAAATCGCGGCCGGCCTCGACATCCG12.083333333333333No Hit
TCGTGAAGTCTTTCGCCGACATGACCGGTGCGCGCTGACCGGAGTCGGCT12.083333333333333No Hit
TTCCAGAACATCCGCCTGTTCGGCGAGATGACCGTGCTGGAAAACGTGAT12.083333333333333No Hit
AGTGGTCTTCTTCGACGGCCGTAACGCATTCGAGGCGAAGATTGGCAAGT12.083333333333333No Hit
ACCACCGCGAGGTCGTGGGAGATCAGCAGCAGGGAGGTCCCCAGCTCCGT12.083333333333333No Hit
AAGCCACATCTTGCCACATGGTGGCAGGTAAAGAGAGAATGAGAACCAAG12.083333333333333No Hit
GTATTTTGTGGGGCACCATGCTGGCGGTGATGCGCTTGTCCAGCTTTGCG12.083333333333333No Hit
CGCCCAACCCCGCGCAGAACAGCAGGAACAGCGTGTTCCATAGCAGGGGC12.083333333333333No Hit
GCAAGGTCCGCTGCGACCGCGCACGGGTCGCCCTCTGTGAGCCCGCGGTA12.083333333333333No Hit
CCATGACGCCACCACCGGCCTCGATCGGATAGGCTGGGCCGCGCGTAATG12.083333333333333No Hit
GTTGCCGCACAGCGGCGCCTTGCCGCGTTCGGGCACCCACTCGCGGACGT12.083333333333333No Hit
GCGTTGGGGCGCGCCAGGTCTGCGACCACTCGGGTCCGAACAGGCCGTCG12.083333333333333No Hit
GGCTAAGAGCGTGCCGTGCGGCGCGCGGCGATTTCCACCGCGCGCCGCAC12.083333333333333No Hit
ACGCGCGCCTGCCGGACGGGTCCCGCGTCAACGTGATCGCGCCGCCGCTC12.083333333333333No Hit
CAATTGGTCGTGCAGCTCGCGTTGGAAATGATGTTGTGTTTGGCGGCATC12.083333333333333No Hit
ATTGCCATTATCATTCTTTCGATGTTCAAATTTTTTATCTTGTAACAGTA12.083333333333333No Hit
AGATGGTGAAGTACCGCGAGAAACGCCTGCAGAACCTGGAAGCCGCCATG12.083333333333333No Hit
GTCGAACAGAATGGCCGGCTGCGGCACCGCCACGCTGCCCAGCATATCGA12.083333333333333No Hit
GATTTCACCTGCGTTTGCTGCAAGCGGGGTAAATGCCATCAGGGCGGCCG12.083333333333333No Hit
ACGATCAAGTGGATTTTCGAGATTCCGTTTCATTGAGCAGGGCCACATCT12.083333333333333No Hit
CGCCGGAACTGGGCGCCGACATTGCCGAGCGCGGCATGATGCTCACGGGC12.083333333333333No Hit
CTGCAGGTGCGCGCCATCGAGCGCCCGGGCGGCATTGTCCACCGCGGCCA12.083333333333333No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG12.083333333333333No Hit
GCGTAGGCCTGGATGGCGGCGTAGTGCGCGTCGATGTCTTCCTGGTACAG12.083333333333333No Hit
AACCAGCGGTCATCATCGTGCAAACTGAGATTAAGCGATGAGCCAATGGC12.083333333333333No Hit
GGCTTTAATAGAAGCCTCTTGCGCCAGTTTGCTGGCATGATGCGCGTGAT12.083333333333333No Hit
GACCAGAAGAGCAGCCTTGTGCCGACCGACATCCGCTGGATAGAAGCCCT12.083333333333333No Hit
CAGGCGGGCCGTGAAACGGTAGGCAAGCCAGGCGAAGGCCAGCGCTTCCA12.083333333333333No Hit
CTTCGGCCCCGCTGGCGGGCGTCCATTTACCGTTAGCGATAAGTTTTTCA12.083333333333333No Hit
TCATCGAGTTCATCGAGCGTTACTGTGTGACGCCCGAAGGCGCGCATGTG12.083333333333333No Hit
GGTAAATTGACGTTTTTCAAGGTATTGAATTAAATTTAGCATCTGACCGA12.083333333333333No Hit
CCCCGGTTGAATAATCGCCGCTATGCCCGGAATAACCGCCCGCGAGGTTC12.083333333333333No Hit
CTTGAAACACTCTTTTTGTGGAATTTGCAAGTGGAGATTTCAGCCGCTTT12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)