FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003670339

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003670339
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGAAGAAATTGTCTGGAGACAGCCATTCCCGGGACCGGGTCTCGGTATTC312.5No Hit
GCGTCGACCCGGTCCCGAGTCGGGACGGCAACTGCCCCCTCGGTCACGAC14.166666666666666No Hit
GGCTGACGCCGATGTTGATCGTGATGATCGCGATCGGCGTCACCGACGTC14.166666666666666No Hit
AGACAAAGGTGCGGACCGGTTGGTGGAGTGTAGCCAGGTAGTTTTGCAGG14.166666666666666No Hit
GGCCACCTGCACGCCCGGCAGCACCAACCCGCAGAACCAGTGCGCTTCGG14.166666666666666No Hit
GTTCGGGTGCCAGCCCATGCCCCAAAGCGTCTTGTCGAGATGAGTATGCG14.166666666666666No Hit
GTGCCCATGCCACCAAGTAATACACTTATGAGTCCACAGCAGCGTACGGT14.166666666666666No Hit
GAATGCGAGTGGGGCGACCGTCGAGCTGGTCGAAGGTGATGAACTCGTCT14.166666666666666No Hit
GTTAACCGAACCTTTCGTGGTTTTCCGAAACTTTCCCGATAATTCCGATC14.166666666666666No Hit
CTCGTAGTTCCAGGCCGCCCAGGCGGCGCGGCGGCGCGGCAGCAGGCCGG14.166666666666666No Hit
CCTGCCTGCAACGCGAGGTGTCCGCGCGGGAGTCCCACGGCGGTGAGGGC14.166666666666666No Hit
CTCATATACCCTGGAACCTATTTCTGGTGGGTACCCCGCTGCGAGCGTGG14.166666666666666No Hit
ACCCAAGGGGGAGCAGGGTGTGGTCTCAACAATCTGAGATCTACAGCCTG14.166666666666666No Hit
GCTATTGCGTCTTCTCCCCCAACTTCAACGGGCTCAAGCTGCTGCCAAAC14.166666666666666No Hit
GAGCACAGGCTGGTCACGGTCTCAGCCTCGGCCGCACAGGTGCAGCACGA14.166666666666666No Hit
ATATATGCGTGAACGAGTGGGCGGTAGGCTGTACGAGGTGGAGATGATGA14.166666666666666No Hit
GCGTCCCGCTGGCTCTCCATCATCGCGCGGGCGAAGGAGCGGTCGATCTT14.166666666666666No Hit
ATTTATAAGTATGACCATGAGATTCACAAGAAGTTATCGTGAAGACCTGA14.166666666666666No Hit
GGCGGTCGTCGACATGCTGTCGGACCGGATCGGCGTGCTGTACCACGGCG14.166666666666666No Hit
GGGATACCAGGAGGGGGTGCTGGCCCGCTTCCAGGCTGTCTCTTATACAC14.166666666666666No Hit
TACCAGGGGTGGTTCGACAAGAATGTGTCAATTATAGTCGCGTCCATGTT14.166666666666666No Hit
ATCAGGATCACAGGCGTCTCGCGCGGCAGCAGCGAAAGCACCTTTTCGTC14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)