FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003670340

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003670340
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCTGATTCACGAACAATCTCCAGCTTCTCCTCGGTAATTTCACCGAGAA312.5No Hit
GCCGATCCCGATGTCCGGCACCGGCAGCGGTTCACCGCCGTTCAGGAACG14.166666666666666No Hit
GCCTGGACGAGAAGGTGGAGCTCACCAGGCGCATGGGCGGAAACGCGCAC14.166666666666666No Hit
CCTTTTTGTCACCGCCGAGTTTGGTGATGTAGTAATTCGGCAGCGGGCCG14.166666666666666No Hit
TCCCGGTGCCGGGCGGACCAAGCAGCACGACGTTCTCCTTGGCGGCGACG14.166666666666666No Hit
GAGCGCGCTCCCACGCGTCGACAGGCCGCACGGTTGACCCGTTCATCCGT14.166666666666666No Hit
CAACCCGAGGCTCCGCTGATCGGGACGGCCCGATGGCAGGCGACCTCCTC14.166666666666666No Hit
ACCAGGGCGTTCATAAGCGTGGGTTTGGCCACGTGAGGGGGCCCATTTTT14.166666666666666No Hit
GTGAGTTCTGGGCTGGGGCCAGCGAGTTGGGCACTGGCTGCAGCAGCAGA14.166666666666666No Hit
GAGATGAACAATAGCGTCGCCATTAGACCTCAGTGTGGAGGAAGAATCGG14.166666666666666No Hit
AACGGGCACCGAAGCGCACTGGTTCTGCGGGTTGGTGCTGCCGGGCGTGC14.166666666666666No Hit
AGCTTGACTAGGTTTCCCAACCTCAAAACCTGTCCAGGCACTGGTTAACC14.166666666666666No Hit
GTGCTAACTCTCCCTGACTCTCGAAACACCCGTCGGACACACTACTTGCC14.166666666666666No Hit
CCTGGAAGCGGGCCAGCACCCCCTCCTGGTATCCCCTGTCTCTTATACAC14.166666666666666No Hit
GGCGCGCGGCCTCCTGGCGGCGCTCCGCCTGCGCGACGGGGTCCGGTACC14.166666666666666No Hit
GAATTAGGGATGAGGTTTCCCAGCGGCATTCAAAATCTGCAGCGATTGGC14.166666666666666No Hit
GGCCGCCGGCGGGCGGCGATGTGGTGCTGCAAAGCGAGCGCGGGCGCGAG14.166666666666666No Hit
TGGCGTGCGCGTCGCGCTCGACGATTTCGGCATCGGCTTCTCCTCGATCA14.166666666666666No Hit
CGGCCCACCCTCGCGACCACACCACGCTCGCAGCGGGGTACCCACCAGAA14.166666666666666No Hit
AACCAGCGGCGTCGCGTCCTCAATGGTCTTGCGGATGGACTCGCCGCCGG14.166666666666666No Hit
GGTTTAATTGTGCATCAGAGATTATTCTAAACCATTTCCTTCCCCAAAAA14.166666666666666No Hit
CCGACATCACGGCCCGGGGCGCCGGCGGCCAGCCCGACGTCATGGCCCTG14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)