FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003672083

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003672083
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTACATCATCGTGTAGACCGACCGCTTCAAACAGTTTCGAGCAGCGGTAA310.0No Hit
CGCAGTCTCAGCGGTGTCGATTACAATGCTATCCGTTTCCGAGTCGTCGT26.666666666666667No Hit
CCCAATTGGCACTTGGTGAAATTGAGCATGTAATGCGGAATCAGAAGTCA26.666666666666667No Hit
GTCCAGCGTGGCGTGGCCCTCCGCGCGCAGCGTCAGGTCCAGGCACAGCG26.666666666666667No Hit
GTTCCCGGCTAATTTATTCTCTACGTTGGCTTACATTGGAGGTCGACTTT26.666666666666667No Hit
ACCCAACTATCTTTCCAAAAAGAAGATTCATTTTCATTATTTTGAGGTTC26.666666666666667No Hit
TGCTCATTCAGTCATACTCTGGCTCTGCCCTCCGGCTGCGTTTGAGCAAC26.666666666666667No Hit
GCTCAATCTAGCCGGCGGGACAAACTAGTTCTCGACGATCTCCACGGAGT13.3333333333333335No Hit
GTGGTAGCTACCACCGACCTGCCCACCGCTTTGGCGGGAACCGACTTCAT13.3333333333333335No Hit
ATGTACATTGACCCCTCGGCGATACCGACGACCGGCTTGTCCGTGATCTC13.3333333333333335No Hit
TTCCTGGACCAAATCGTGTGGCCCGTGCTCTTCGAGCTGGCTATATACCA13.3333333333333335No Hit
CCCCAAATGTAGGCTTTGCCCACTTGAGCCGTGGCGTAGTTGACAATGGC13.3333333333333335No Hit
GTTAATGATCAGCCCACTGACGCGTTGCGCGAGAAGATTGTGCACCGCCG13.3333333333333335No Hit
GTTAAAATGGCGGTGTGGACTCCAGGTTCTTACCTAGTCCGTGAATATGC13.3333333333333335No Hit
TATGGGCCGCCGGCGACCGAGACGTTGGCGGTGCCGTGGCGGCGCTTGCC13.3333333333333335No Hit
GCATTCCAGAACACAGCTCTAGACTTCTTCGTCATGCTTGGATCTGTCTC13.3333333333333335No Hit
CCTCTCGCCGCTGGTACGCGTCGACCAAGTCCGTCATCGCCTTGATCTCG13.3333333333333335No Hit
CCACCAGACTGGGCAGGAACGAGCCGTAGGTCGGGTGAAACTGCAGCTCG13.3333333333333335No Hit
ACAAGTTCCTGTCCAATAATCCCTAGAATGGTCCCTAATGCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
GACTTCACCAGCACTTCGAGCGCGGCCTTCGCCGCGGCCGATCCCGGATA13.3333333333333335No Hit
CTGCTGAAGTTGTCCTGGGTCTGGCCCTCGACATGCAACGCAGCGGCGCC13.3333333333333335No Hit
AGCGACTCCAACTTCACGAAGTCGAGTTGCAGACTTCGATCCGAACTGAG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)