FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003672084

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003672084
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGTTGCTGGGCTTCGGCGCGACGGCTATTTATCCATACCTTGCCTATGA310.0No Hit
GCTCATCATCCGCTCGTTCATGAGACGAAACAGGTGGTTGATTACGTTTA26.666666666666667No Hit
GCAACCAAAAATCCGACGGCGACAACACGCGGTCCCTTCAGGCGCAATCC26.666666666666667No Hit
TATCAGAACCTCAAAATAATGAAAATGAATCTTCTTTTTGGAAAGATAGT26.666666666666667No Hit
GTTGAGCACAGGGACTCACCCGAGCTGGCAGAGTGTATTCCCATCGTATA26.666666666666667No Hit
GGGCAGAGGCTATATACGTAGCACGGGAGGATCGGTTTCAGTTCGAATTC26.666666666666667No Hit
CATTAGGGACCATTCTAGGGATTATTGGACAGGAACTTGTCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
CCTGCCGAGCGTGCAGGCGCAGGCCTTCGGCAGCGACCTGCAGGCGCACA13.3333333333333335No Hit
CGCCCGAACGTGGGCCAGTCAGCATTGAATCCTACTATGATGACTACCTC13.3333333333333335No Hit
GGCCTACAGCGGGCATCAGGGCGACAGTAAACGCACGGTGGCCTTCAACG13.3333333333333335No Hit
AATTCACCCGCTAAGACTACGACCGCGAAAACCACACCGAACTGCTGTGG13.3333333333333335No Hit
GCATACAGGTCCTCAAATACCTCGTGCTCGCGAACATGCTCACGGGCGCG13.3333333333333335No Hit
CCTGCCGCGCGCGGCGCTGGAGCGCGCCTTCGCCGTGATGGCAGCGGCCT13.3333333333333335No Hit
ATCCAAGCATGACGAAGAAGTCTAGAGCTGTGTTCTGGAATGCCTGTCTC13.3333333333333335No Hit
AGGTGGAGCTAATCCCTAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATCGAAGTCTGCA13.3333333333333335No Hit
GAGCTGAATTACATTCCCAACCGCGTGGCACAACAACTGGCGGGCAAACA13.3333333333333335No Hit
GGACGGGCGTCTGGTGGTCAGCGGCGGGCGCCTGATGCTGGCCGAGGGGC13.3333333333333335No Hit
ACCGATGACCCCGCGAGCCAGGCACATCGACTCATCGAGGGCACGTCCAT13.3333333333333335No Hit
GTTACCTCCTGAGTAGTGGAGTTTACCTTAATACGCCAAGTATTCTTGTT13.3333333333333335No Hit
GGTGGGGATCCGACTGGCACAGGCCGGGGTGGCCCCGGTTACCGCTTTGG13.3333333333333335No Hit
GAATGAAGGGACGAAAGTGCAAAAGAGGCCGTCATGGTTGTAACACAGGG13.3333333333333335No Hit
GGCAACCACCGGGCGGACTACCTCCGGATGGACCCAGATCACCCATCGGG13.3333333333333335No Hit
AATTCACCCGCTACGACTACGACCGCGAAAACCACACCGAACTGCTGTGG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)