FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003672703

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003672703
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCCAAAACCCCACACCGAAAACAAAGGCTTGGTTTGGAAATCACCACTG33.125No Hit
GGATTTATCTTCAAAGAACTCCAATTACAGAATTTAGTCACTGGAATCCC22.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGG22.083333333333333Clontech Universal Primer Mix Long (96% over 26bp)
GGTTGTGGGCTTCCTGAACCGCGCACTCCGCACAGACCTGGTTAGCCCCA22.083333333333333No Hit
GCAGAGATCTGCCCGAGCTTTCAGCGTGTCATCGAAACCCTCCTCATGGA22.083333333333333No Hit
CCACAAAGGTGCTGCCAAGGACCAGGATGATGGAGACGCCAAAGAAGAAG22.083333333333333No Hit
GTTATCTTCTGCTCCTTTAGCTGACTAGATGGAGCTCAAGTGGTTGGGCT22.083333333333333No Hit
GAGAAAACCTGGGCTTGGGAACAGTTTAGGACTCTTGTCTTCAGCATTTC22.083333333333333No Hit
AGTTTGTGGATGGGTTCATCTGCCCATGAGTTCTGTAAGTCAGGTGGTAC22.083333333333333No Hit
GCCATTAGGTAAAACAACCTTGATGTTATGATACCTCAATTGTTCTACAC22.083333333333333No Hit
GCCTGGAGGCCCCGCTTGCCCATCTGACAGAAGAAAACGAGATGCTCATC22.083333333333333No Hit
TCAGAATCTTGAGGAGCAAGGCAGCTATTAATTAGAAAAGGTATCTCCAC22.083333333333333No Hit
CTGATTCCCCGTCACCCGTGGTCACCATGGTAGGCACGGCGACTACCATC11.0416666666666665No Hit
GAATCGAAGAGAATCTTCGAACGGACCCGAATGGAATCATCTAATGGAAT11.0416666666666665No Hit
GGCGCATTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCATATTCAAGTGATTG11.0416666666666665No Hit
GGATGGAGTTCAGGGAAAGAGGAAGATTCAGTAAAACAGAAAGCGTGAAT11.0416666666666665No Hit
GGGTGACAGCGAGTTTCATGGTGGAGGAGGGGGATGCTCTGGCCCGTCTC11.0416666666666665No Hit
TCCAACGCTTGGTGAATTCTGCTTCACAATGATAGGAAGAGCCGACATCG11.0416666666666665No Hit
GTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAGGCCATG11.0416666666666665No Hit
GTACGAGAGGAACCGCAGGTTCAGACATTTGGTATGTGCTTGGCTGAGGA11.0416666666666665No Hit
CCTCACAGGTGCCCTTGTTTTCTGACGTATGTGTCCATAAAGCCTTCCCA11.0416666666666665No Hit
CTTCTTGATCTTCATCACAGCACCTCCGGCGCGAGCGAGATGATCTTCAC11.0416666666666665No Hit
TCTTCGTGAAGACACTCACTGGCAAGACCATCACCCTTGAGGTGGAGCCC11.0416666666666665No Hit
GTGCGCAGCCCACAAAGCCTTGGGCAGCGTCTGGGTTGTGCAGGAAGCGG11.0416666666666665No Hit
ACTCTAAGAAATGTAAAACACAGTTGGGCGTAGTGGCTCACACCTACAAT11.0416666666666665No Hit
GATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCAAGCAAATTTATTATAAATTT11.0416666666666665No Hit
CGCCCCGCGCGCGCGGGAGGGCGCGTGCCCCGCCGCGCGCCGGGACCGGG11.0416666666666665No Hit
GCAAAGACGAGACTACCTGCTTCTGGTGATGGAGGGCACAGATGACGTGC11.0416666666666665No Hit
GGTTCCTTCATTAGTGACGTTTGCATGCCCCCTGGGTGCCAGACACTGTA11.0416666666666665No Hit
GCCCGTGGCGACATCTGGGCAATCTCCGCCTCCTGGGTCGACTGGCTGGC11.0416666666666665No Hit
GGAAGGGAAGAGAGATGGAGATCCCGGGTGGGAAAGCGACAACATGCATC11.0416666666666665No Hit
AGACAGACAAGAAAAAAAAAGTTTGAAAGACATGAAAATGTGGAAGAAAA11.0416666666666665No Hit
GAACAGGCTCCTCTAGAGGGATATGAAGCACCGCCAGGTCCTTTGAGTTT11.0416666666666665No Hit
ACCCAGGGGAGAAAGTGTTCCTTCATGAGAACATTAGGAAATCAGGAAGT11.0416666666666665No Hit
ACTCTGGACATTAACGAAAAAGACTGGAATAGGGCTACAGCGCTGCTTTT11.0416666666666665No Hit
CACTTGCTGGCTTGCGCATCAGGACTGGCTTTATCTCCTGACTCACGGTG11.0416666666666665No Hit
GCTCACCATAGTCTAATAGAGAACAACCGAAACCAAATAATTCAAGCACT11.0416666666666665No Hit
CCATCTGTCATGGCGGCTGGGCTGTTTGGTTTGAGCGCTCGCCGTCTTTT11.0416666666666665No Hit
GGTTTCCCGTGTTGAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTG11.0416666666666665No Hit
CTCTCTAGCAGAAGTTGAAGAGAAATATAAGAAGGCTATGGTTTCCAATG11.0416666666666665No Hit
GTACATGGGACTAGCCCACCAGACTCAGAGACGGAACCAGAGACAGGCCA11.0416666666666665No Hit
GCTCTGTGTGTCAGCACAGGAAGTGGTCTCCCAGCGTTCAGCCTGAAGCA11.0416666666666665No Hit
GCCAGACGGTCATCAAGGGCATGGGCGAGCTGCACCTCGACATCCTCGTG11.0416666666666665No Hit
AAAAAGTACTCTGCGTTGATAACACTGCTTCCCATGTACTCTGCGTTGAT11.0416666666666665Clontech SMART CDS Primer II A (96% over 26bp)
TATTTGTTCCCACTCCCTCCCTTTATTCTTCCAAAGAACTGCAGAAACAA11.0416666666666665No Hit
CTTTATTCCTGCAAGAATGGCCATTATCAAGAAGTCCAAAAACAATAGAT11.0416666666666665No Hit
ATCCTGTCCGTGTCCGGGCCGGGTGAGGTTTCCCGTGTTGGGTCAAATTA11.0416666666666665No Hit
ATATACACCATTTGTAAACAAAATTGCACTTGATTTTGCTTTTTTAAATG11.0416666666666665No Hit
CCTTATGGGTTTTAAGCAGGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAAC11.0416666666666665No Hit
ATTGAAGAGAGCAAGGCTGGTGGGCGTGGACTCAAAGCATGGCAGCGGCA11.0416666666666665No Hit
TTCCTGGGCGACGTGAACCTGTTCCACGGCCGCGCCGACAACGGCGCGGT11.0416666666666665No Hit
TAAGAGGGACGGCCGGGGGCATTCGTACTGCGCCGCTAGAGGTGAAATTC11.0416666666666665No Hit
CTATTATTCGGCGCATGAGCTGGAGTCCTAGGCACAGCTCTAAGCCTCCT11.0416666666666665No Hit
GACCGGCGATGCGGCGGCGTTATTCCCATGACCCGCCGGGCAGCTTCCGG11.0416666666666665No Hit
AGGCTGTCTTTGGCTGGGGATGTGGAGAAGACCCTGCAGATTCGCTCCTT11.0416666666666665No Hit
CACACAACTGTCCTGAGCACTGACTACCCCATGTACTCTGCGTTGATACC11.0416666666666665No Hit
GGGGTCCACAGCTCTTTGCCTGCTAACCCTGGAGGGTTCTAAGCCGATGC11.0416666666666665No Hit
ACCTCGGGCCGATCGCACGCCCCCCGTGGCGGCGACGACCCATTCGAACG11.0416666666666665No Hit
TTTCGGAACTGAGGCCATGATTAAGAGGGACGGCCGGGGGCATTCGTATT11.0416666666666665No Hit
CCACAAGCATCTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAT11.0416666666666665No Hit
ATCCAGCATATAAACAGAACCAAAGACAAAAACCACATGATTATCTCAAT11.0416666666666665No Hit
TGAGAAAACTGAGGTTCAGAGTTTATGGAACTCACCTAAAATTAAAGTTA11.0416666666666665No Hit
CCCCATCACTCTTTGAGACTCACCATATATAAAGATTTCATATGCTCTTG11.0416666666666665No Hit
GTGAGCTTTGGGCTATTTTTTCCATGAGCTTAATGATGCTTTCTCTGGGC11.0416666666666665No Hit
GCAGGCTCTCTGCTGCAGCTCCGCTTCTGCAGAGATCTGCCCGAGCTTTC11.0416666666666665No Hit
CGCTCGCGCAGCGCCGCCGTGCGGCGGAAGGTCAGCGACTGAAGCAGGCC11.0416666666666665No Hit
GTCTTCTCCCTGTGTCCTCATATGGCAAAAGGGGTGAGAAGTCTCTCTCA11.0416666666666665No Hit
CTTAGCAACTGGTCACTCATCCTCTGGCAGCTGGATCTTGCTGGGGTCGA11.0416666666666665No Hit
CCCGGAAGCTGCCCGGCGGGTCATGGGAATAACGCCGCCGCATCGCCGGT11.0416666666666665No Hit
TCCCAGCTCAGTGCCGAGTACGACAATAATCGCCACACCCATCATAATAA11.0416666666666665No Hit
ATGGTACACTGGCCAGTGTGTTTTTGGCGATTAAACATAATCCTGTGAAT11.0416666666666665No Hit
GGTTTGTTCAGCTTCTTGGATCTGAGGATTTATCATTCCCATTAAACTTG11.0416666666666665No Hit
CCGTTGGGGCGGAGGCTGCCCTTGCAGCGCCGCAGGAACTCGGCCAGGTG11.0416666666666665No Hit
GTCTGAGACCTTCACCCGGATCTCCAGACCCAGAATAAGTGTGTCTGGGA11.0416666666666665No Hit
AAATAATACAACTCCTATTCGCTGACTTAGTTAAAATTGATTTGTTTTCA11.0416666666666665No Hit
CTCCGCTTCTGCAGAGATCTGCCCGAGCTTTCAGCGTGTCATCGAAACCC11.0416666666666665No Hit
TTCTAGAGCTAATACATGCCGACGGGCGCTGACCCCCTTCGCGGGGGGGA11.0416666666666665No Hit
AATTTGGAGTTAAGAAAATAGGGTCAGTGGGTTGGCAGGACAGAACCCAG11.0416666666666665No Hit
ATTTTGAGATACGTCCCATCAATACCTAATTTATTGAGAGTTTTTAGCAT11.0416666666666665No Hit
CCACAAGCATCTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAT11.0416666666666665No Hit
GAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCAC11.0416666666666665No Hit
GGCGGGGACAGGCGGGGGACCGGCTATCCGAGGCCAACCGAGGCTCCGCG11.0416666666666665No Hit
TGCTAGGGTGGCGCTTCCAATTAGGTGCATGAGTAGGTGGCCTGCAGTAA11.0416666666666665No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)