FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003672704

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003672704
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGCTGGGTCGATGGGGTCGGATTCTGCCAGTTTCTGCTCTGCAGCCAAA33.125No Hit
TGGCTCTTCACCTTGAAGGAGGCATCAGTGACCGCTGGTGGCCAGGGTGA22.083333333333333No Hit
TTATTCACTATGACCCAGAAAATCCCACGAAGTCGTGCATGTTAGAAGGA22.083333333333333No Hit
ATCTGTCATGGCGGCTGGGCTGTTTGGTTTGAGCGCTCGCCGTCTTTTGG22.083333333333333No Hit
CATATTGTTCCTTGTTTCTTACCATGAACCATGCAAACCTACCCCAAAGT22.083333333333333No Hit
CTCCTAAGACAGTTTCATGGGTCATTTCTCGGTACTTTGGTTTAGAAATA22.083333333333333No Hit
CATGTCTTGATCAGGGCTGAAAAGTTCCATGGCAGCCTCATAACTGGAGG22.083333333333333No Hit
ACCTTGCAGTTTCTTTTCTCTCTCATCCTAGGCTACTGTTTGTGATTGTC22.083333333333333No Hit
GCCGCACTCCGGAGACTCGCGGTTGCTACGCGCACCATGGCTGGAGCCTC22.083333333333333No Hit
CTGCTTCCCATGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTCCCATGTACTCTGC22.083333333333333Clontech Universal Primer Mix Long (96% over 26bp)
CGACGGCACTTTTATTTAGTGCCTGCTTTATTCAGAAAAAGGTATAAATC22.083333333333333No Hit
GCTCCCAATGAAAGCCTTTCCACAGGGCAAATATAAAAGAGAGAGTAGAG22.083333333333333No Hit
AGGATGGTGTCAGATTCCCCTGTCCTCTGATTAGCTCCCTCTGCCAAGGT11.0416666666666665No Hit
GCCCTGGACTGTGGAGCTGGCATTGGGAGGATCACCAAGCGGCTGCTCCT11.0416666666666665No Hit
TGAAGATCATCTCGCTCGCGCCGGAGGTGCTGTGATGAAGATCAAGAAGC11.0416666666666665No Hit
ACCAGACTCAGAGACGGAACCAGAGACGGGCCAGAGCATCCCCCTCCTCC11.0416666666666665No Hit
TATCTGAACACACAATAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACT11.0416666666666665No Hit
GTTCCTGATCGGTTCGGACTACGTGTATCCCTACGAGTCCAACCGGATCA11.0416666666666665No Hit
CAGTCAATTCATTCGATGACGATTCCATTCAATTCCGTTCAATGATTCCA11.0416666666666665No Hit
GGTCACAGTATCATACTCCAGCAGGCGCCCGTCATCTGTGCCCTCCATCA11.0416666666666665No Hit
TGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGT11.0416666666666665No Hit
CTTCTGTAATTTCTCCAAAGCCTTTTGACACTGTGGCCAGTTCTGCAGAA11.0416666666666665No Hit
TGTTTATAAAGCACAAAAAAACGAAATACTTTTCTTAGTTAAAAAGTTGA11.0416666666666665No Hit
GTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGAACTGAGGCCATGATTAAGAGGGACGGC11.0416666666666665No Hit
GAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTAATGAA11.0416666666666665No Hit
GCAGTATACTGTGGGCGTGTTTTTCCCTTTCAAATTCTTTGTTTTTCTCT11.0416666666666665No Hit
CGTAACTAGTTAGCATGCCAGAGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAACCAGA11.0416666666666665No Hit
ATACCACTGCTTCCCATGTACTCTGCGTATCAACGCAGAGTACATGGGAA11.0416666666666665No Hit
GCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAAT11.0416666666666665No Hit
GTACGAATACAGACCGTGAAAGCGGGGCCTCACGATCCTTCTGACCTTTT11.0416666666666665No Hit
ACAGTGAGCTTTGGGCTATTTTTTCCATGAGCTTAATGATGCTTTCTCTG11.0416666666666665No Hit
CTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTCCTTTAAGTTTCAGCTTTGCAACC11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG11.0416666666666665No Hit
GTAATGAGTGCCCATAAAGATAAGGACGCTGTAAGCAGGAGGAAGCTGGG11.0416666666666665No Hit
CCTCATGGACACACCCTCCAGTTATGAGGCTGCCATGGAACTTTTCAGCC11.0416666666666665No Hit
CACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGCCTGGAGTTCGAGA11.0416666666666665No Hit
CTCCTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCCGACGGG11.0416666666666665No Hit
GAACTGGGCTGCAATGAACATATATGTGCATGTGTCTTTTTCATTAATAA11.0416666666666665No Hit
GGGTTTCGATGACACGCTGAAAGCTCGGGCAGATCTCTGCAGAAGCGGAG11.0416666666666665No Hit
GAGTGCAGTAGTGCAGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTTCTGGGTT11.0416666666666665No Hit
CCAATGGATCCTCGTTAAAGGATTTAAAGTGGACTCATTCCAATTACAGG11.0416666666666665No Hit
GCATGGCAGCGGCAGAGGCTGGAGCAGTTGGGGATCTTCAGCTTCTAAAT11.0416666666666665No Hit
GTAAATGCCCTTATAAAAGAAACCTGAGAGAGACTTCTCACCCCTTTTGC11.0416666666666665No Hit
TGTCATAACCATGGGAGTCTGGGTTCTTCTCATACAAGTTTTCGTCCTCG11.0416666666666665No Hit
TTTGTGGCCTATCTGCCTGACTACAGGATGAAAGAGTGGTCCCGCCGCGA11.0416666666666665No Hit
GGTGAATGTCACTGCCATGAATTCCTGAATCTACCTGCTGCTGGGAGTCA11.0416666666666665No Hit
CTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACACCTA11.0416666666666665No Hit
GAATGCTTCCAGTTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGCTGTGGGTTCGT11.0416666666666665No Hit
GTTGTTGCCATGGTAATCCTGCTCAGTACGAGAGGAACCGCAGGTTCAGA11.0416666666666665No Hit
ATTCCCATGACCCGCCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTCTTTGGGTTC11.0416666666666665No Hit
GGCTGGAGTGCAGTGGTACAATCATAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTG11.0416666666666665No Hit
CACCCAGGTTGTCCCACCAGAGCGGAGAACAGCCTTGGGAGTCATCTTTG11.0416666666666665No Hit
TCCAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAA11.0416666666666665No Hit
GAGCTATACCCAGAGTTCTTCGCTCCACTCACTCAAAATCAGAGCCACGA11.0416666666666665No Hit
TCTACGAATGGTTTAGCGCCAGGTTCCCCACGAACGTGCGGTGCGTGACG11.0416666666666665No Hit
CTTCAAGGCGGTGGACGGCCTGAGCCTCTCGGTCGAGCGCAACGAGCTGC11.0416666666666665No Hit
GATTCAGATCATTTAAAAAAGCAAAATCAAGTGCAATTTTGTTTACAAAT11.0416666666666665No Hit
CCTTCAAGCCCAGATCGCGGAACTGTTGCGCAGGGAGTTGCGCTTCGATG11.0416666666666665No Hit
GGTGAAGGGAGACTCGAAGTACTCTGAGGCTTGTAGGAGGGTAAAATAGA11.0416666666666665No Hit
TCGCGGGGCTGGCCTTGCGGATGGCCTCCTTGAATCCCATCGAGCCGGCG11.0416666666666665No Hit
GGACGGCCAGCGCGATGCCCATTACCTGTAGCCCCATGGAGGCCATTGTT11.0416666666666665No Hit
GCAAAAGGCTTAGTTCTAAAAAACAGAGACCCACCAAGACAACTAATAGT11.0416666666666665No Hit
TGGGAATAACGCCGCCGCATCGCCGGTCGGCATCGTTTATGGTCGGAACT11.0416666666666665No Hit
CTCGGGCAGTCGCCTGTCCAAGGAGCTGTTGGCCGAGTACCAGGACTTGA11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATT11.0416666666666665No Hit
GAGTTGGGGGAACGGGACTGGGTCCTCACTGTTCATTTTGCAGGCTTTTA11.0416666666666665No Hit
CCCGTGGTCACCATGGTAGGCACGGCGACTACCATCGAAAGTTGATAGGG11.0416666666666665No Hit
GTTGGAGATCCAGGAATAGAAAGCAGAAAAAATCCTGGAGAGAAAAATAT11.0416666666666665No Hit
GGTATCAACACATCATCAGTAGGGTAAAACTAACCTGTCTCACGACGGTC11.0416666666666665No Hit
TGGACACACCCTCCAGTTATGAGGCTGCCATGGAACTTTTCAGCCCTGAT11.0416666666666665No Hit
GTATCAGGAGAAAAAACACAAACAGAAAACACCTTTTGTCGCGCATCCAG11.0416666666666665No Hit
GACTTCATCAACAGCCCTGCTCTGAGAAGTCATACCTTGTGTTAACCAAT11.0416666666666665No Hit
GGCGGGGACAGGCGGGGGACCGGCTATCCGAGGCCAACCGAGGCTCCGCG11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGAATAATTGCAATCCCCGATCCCCATCA11.0416666666666665No Hit
CTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCC11.0416666666666665No Hit
GTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACC11.0416666666666665No Hit
ATATATCACAGGTGTGTCCACAGCTGATAAGATCCCTTTGTGAGGCCTAG11.0416666666666665No Hit
GTTCTAGGGAAAGTGGCTTCCTGCCCAAACTGGATGGGACACGTGGGGAG11.0416666666666665No Hit
TTTTTTAATAGCATCCAATCTTGGTTAATGAAGAAATTTCTCACTTCTCT11.0416666666666665No Hit
GTTGTATGGCCAGTGTTGGATGTTGGCTAGCATGCTTTTTGGTTGGTCAG11.0416666666666665No Hit
GACTCAGACGGAGCCGCCGTGTTGGCAGCGCCTGGGTGTGGGCCCATTTT11.0416666666666665No Hit
GTTGGGCTATGACTTCTGGTACCAGCCTCGACACAATGTCATGATCAGCA11.0416666666666665No Hit
GTGAAATACCTTCTCAAATCACAGCTATCAACTACAACCCCTCACTGGTA11.0416666666666665No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)