FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003674087

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003674087
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCTTCCAGCATCAGCGGTTTCCCTTCCACAAAACGAACGCGACGGGAGA45.333333333333334No Hit
GCCTCTGGTGTGTTTATCACTGTGCCAAGTGCTGTGAGTAATGGGTATGA34.0No Hit
AAACTAACCTGTCTCACGACGGTCTAAACCCAGCTCACGTTCCCTATTAG22.666666666666667No Hit
GCTCTGGGTGCTGCACACTCTGGGAGCATGCAGCTCTAAAGCTGTCTCTT22.666666666666667No Hit
GGATTTCAGATTTTATTGGTAAATAAGGCAAACAAAGGAAGAGAAACATA22.666666666666667No Hit
GTATTTTTACATGAGATAATCAGGTAGTCATTTGCCAATATTGTTACGGT22.666666666666667No Hit
CCAGGAGACTTCCCCATGACAAAATCCCATCTGGCCCTGCGGGGCCTGCT22.666666666666667No Hit
GCCTGACCTTATTCCATCCCTCAGCAGCCTCTTTATCACCTCTTCTAGCT22.666666666666667No Hit
AGCACATACACCAAATGTCTGAACCTGCGGTTCCTCTCGTACTGAGCAGG22.666666666666667No Hit
AGATTGGAATATCCTTTCACAATGGTTCAGAATGATGTGGTAATGGAGAT22.666666666666667No Hit
ACCTCATCCCATGAGACCCTGGTGCCTGGCTCTTTCGTCACCCTTGGACA11.3333333333333335No Hit
ATCTGTTTCTGCCTGCCCAAGCCTCAGACTCACAGACTCTTCAACAGAAG11.3333333333333335No Hit
CAAGTAAGATGTAAAGAGAGAATTCTACAAGTGATGAGAAAGTGGGATGC11.3333333333333335No Hit
CTCAGTGACATGGCATCTTCAGAGATTTTGGGGTGCTTCTGGCTACTTTT11.3333333333333335No Hit
CTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGAAACCT11.3333333333333335No Hit
CAGGGATATAAGGTGAGCACAGAGAGGTAAAGGCTTCAGTGATTCAGGCC11.3333333333333335No Hit
ATCGTGTACCCAAAATGGAGGAGGCGCGCGTGTTCGTTTGGTGGATCGCT11.3333333333333335No Hit
AGATAACACTGGAAAAACCCTTCTAGATATTTGATTAGGCAAGGATTTCA11.3333333333333335No Hit
CCCATCAGACTCAATCGTGGATTGGGTACTTAAAACTGTTCCAACCATGG11.3333333333333335No Hit
TCTTTAACTAGCGTGAGGTCCTCTCTCCTACACATTCCCAGCCTCTGCAC11.3333333333333335No Hit
AAACTGCTCTGTCAATAGAAAGGTTCAACTCTTTTTGTAGAATCTGCGAG11.3333333333333335No Hit
GCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAAT11.3333333333333335No Hit
AGCCTAATGTGGAAAGAGAGCTGGTTCAGTCCTCATAAGAATTCCTATTC11.3333333333333335No Hit
ACCTCGACCATTCCCGGCGACAGATCGATGCCACGCACGAGAACTCCTCG11.3333333333333335No Hit
GAGGTGGCCTGCTGCAGGAGCGCCAGATACTGTGGGGTCAGTCCGCCCAG11.3333333333333335No Hit
CCATTGTGAGAACTAAAACTATACAAGTTCTTAGAAGAAAACACAGGCAT11.3333333333333335No Hit
ATTGAGAGGACTATTTCTGACATGGAAATTCAAAATAAATATGACCTATA11.3333333333333335No Hit
GAGAATCATTCTGTCTAGTTTCTATAGGAAGATATTTCCTATTCTACCAT11.3333333333333335No Hit
GGTGAGAGTGATACTCCTCACTATTGGGAACTTTCTTCACAGCTGCCTCA11.3333333333333335No Hit
TCCCAGAGTCTTCTGCAGCTGTGTGGATCAAGGAGGCCACATTCCTGGTT11.3333333333333335No Hit
GTGCCAGGTGGGGAGTTTGACTGGGGCGGTACACCTGTCAAACGGTAACG11.3333333333333335No Hit
GCAGAGATCACGCCACTGCACTCCAGTCTAGGCAACAGAATGAGACTCCA11.3333333333333335No Hit
CTCCTCACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGAT11.3333333333333335No Hit
CTATTATCCAAAGCAGCTGCGCCATTTTACATTCCTACCAGCAGGGTCTG11.3333333333333335No Hit
ACTGAGAACCAGCCACCCGGAGCTCAGTTTCTGCTACAGAGCACCTCCTC11.3333333333333335No Hit
TCAAAAAGCTTATCCCCCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAA11.3333333333333335No Hit
GGTTTGTTGCCCTTGCCAATAACAAAAATGTTGGAAAGTCGAGTGGCAAA11.3333333333333335No Hit
TAAAAAGACACTGTGTAACCAGTCGCATGTAAATGTTTAATAATTCAGAA11.3333333333333335No Hit
ATAAAACTTATTGATATTATTCAAACTCTCCTCTGAACAGCATAAAGGTG11.3333333333333335No Hit
AGCCCCGAGGGGCTCTCGCTTCTGGCGCCAAGCGCCCGGCCGCGCGCCGG11.3333333333333335No Hit
AATTTGGCTCCTGATTTTTTGAAACCTCTCCCTATCTAGACTGGCCTGTG11.3333333333333335No Hit
TTTAAGTAAGATCTTCATTATTTTTGCAAACAAAATGCTAAATACATTTT11.3333333333333335No Hit
AGAAGAAAGTGATGAACACATCTCTTTTAAAATTAAGATCTAGAAGAATA11.3333333333333335No Hit
AGACTTGCCCTCCAATGGATCCTCGTTAAAGGATTTAAAGTGGACTCATT11.3333333333333335No Hit
CCTTTGGCCTGTGGAAGCTGGAGTTGGTTCAGTGGAAGCAGAACATCCAT11.3333333333333335No Hit
AGATGTACCTGTGAGGTTTGCTACACAGGTAAACTTGTATCACAGGGGTT11.3333333333333335No Hit
GGGCAGAAGTGCTCGGCAGCGTCGCTCATTATCTTGGTGGGTCAGGCCTA11.3333333333333335No Hit
GGTTTGGTGTTTTTATTACCTTGTTAACTGTCATTTTATTTTGGTTTGTT11.3333333333333335No Hit
GGAACTGACACAGGATATGGTTTGAAAATAGAACTGAGGCCGGGCGCGGT11.3333333333333335No Hit
AAGCCAGACAGAGACACAACCAAAAAAGAGAATTTTAAACCAAAATCCTT11.3333333333333335No Hit
CCAACCTGGAGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGAC11.3333333333333335No Hit
GATGCGGCTTGGCGTCGACATCAAACTGCAGGGAACAACTGCGCTGGTAC11.3333333333333335No Hit
ATTCCGTACGATTCCATTCTGTGATGATTCCATGTGATTGCATTCAATGA11.3333333333333335No Hit
GTATAGCATTTTGGGAAAACAGATAAACTTCATTTTGAGAAAGTATAGTA11.3333333333333335No Hit
GTCTAAACCCAGCTCACGTTCCCTATTAGTGGGTGAACAATCCAACGCTT11.3333333333333335No Hit
CCTGCACCGGTGCGCCGCACGCTTCCGACAGATCGTGGTGGATCAACTGC11.3333333333333335No Hit
CGACAACGCCGACCTGACTCGCATGCTGGCCACGCTGGGCGCGGCCAACG11.3333333333333335No Hit
CCCTTGCGCAGGCCTCCGACTACGTTTCCGAAAACCCGAACGAGGCCGCG11.3333333333333335No Hit
GTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATCTGTCTCTTA11.3333333333333335No Hit
CACACACACAGAGGCAGAGACACAGGCAGAGAGAGAAGCAGGCTCCATGC11.3333333333333335No Hit
ATCATGTCATCTGCAAACAGGGACAATTTGACTTCCTCTTTTCCTAATTG11.3333333333333335No Hit
CTCGTACGTCAGCTGCTCTTTTCCGCCATCAGCCTTGGCTGAGCTGGAAA11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)