FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003674088

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003674088
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATCTAGAGATGATCTACAAAAGCATTGCGGAGCGGTTAAGAATTCGACTT45.333333333333334No Hit
GTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGT34.0No Hit
GTCCATTTTCATGCTGCTGTTAATTTCTTTATACATTATGGAGACTGAGT22.666666666666667No Hit
GCGCTACGCACCGGCAGCATCGCTGCCTCGTCCGCGGGTGTGGCGGGAAC22.666666666666667No Hit
TCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCA22.666666666666667No Hit
CTTTAGAGCTGCATGCTCCCAGAGTGTGCAGCACCCAGAGCCTGTCTCTT22.666666666666667No Hit
GTGATCTGCGTGGCCAACATGGTGAAACCTCTTCTCTACTAAAAATACAA22.666666666666667No Hit
CTTCTGACCTTTTGGGTTTTAAGCAGGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAG22.666666666666667No Hit
CCCTGATAGGATCCAATTTCTTTCCTGCATTACACACATTTCTGTCAACT22.666666666666667No Hit
GGTAAGAGCTGCACCTTTAATTGAACACTTACAAAAATCGGGTAGGTTCC11.3333333333333335No Hit
GGTTATTACACGGCAGCTCTGGTGGCTCAGCAGTTTAGCGCCACCTTCGG11.3333333333333335No Hit
CAGTGCAGCAGATATTTTTGGGAAGTCGTTTATGGTGTTCCCACTCCCAT11.3333333333333335No Hit
GCGTCAAGGCGCTCCAAATGTCCACTTCCAGATACTACAAAAAGAGTGTT11.3333333333333335No Hit
ATGGAATCACCATTGAATGGACTCGAATGGAATCATCATGGTATGGAATC11.3333333333333335No Hit
GAACAATCCAACGCTTGGTGAATTCTGCTTCACAATGATAGGAAGAGCCG11.3333333333333335No Hit
CAACATCATAAGTCATCACAGAAATGCAAAATAAAACCACAGTGAGATAC11.3333333333333335No Hit
GTAACGCAGGTGTCCTAAGGCGAGCTCAGGGAGGACAGAAACCTCCCGTG11.3333333333333335No Hit
CTGTTCGGCCGTGCTCATGCCAGGACGTCCAGCGACACGTGGTTGGCGAA11.3333333333333335No Hit
GTTTAAGAACCACTGCTGTAGAGGGGCAGTAGAATTTGGGGTAAAAATTA11.3333333333333335No Hit
AGAAAACAGCCACTAAGTAAAAGGACACAGAGGAGGCAGTGACCGCAAGA11.3333333333333335No Hit
ATTATATTCTCCTTCAATGATTTCCTCACTATTGGTGGACCTGTCTCTTA11.3333333333333335No Hit
GAATAAACTACCAGTGAAAAGCGAATATCCCTCTATAAAACTGGTGGTGG11.3333333333333335No Hit
TGGTTGTTGAGCGTGTCGGCCAGCGTCTTCTGCAGCGAGGCGAGCTGCAG11.3333333333333335No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTC11.3333333333333335No Hit
GAGTTTGCAGTGAGCCCAGATCGCATCATTGCGCTCCAGCCTGGGCGACA11.3333333333333335No Hit
CTTATGAAACATTGAGAAGTAAAAAAAAAGCAGCATGAAACAAGAAAAAG11.3333333333333335No Hit
GGTTGAAAAGAACTGTGCGGATAGACTGGCGCAGTTTCACAGGATCCACA11.3333333333333335No Hit
ATAGAAGAATGCCGGATCCTCCGGGGACCTGATGGGCTGAGTCGAGGCTG11.3333333333333335No Hit
AATTTGCCGTTGGCGGGCTCGGCAAGCGGACCCATCTGGGAACGCAGATC11.3333333333333335No Hit
GGTAAAAAAGTTCTCCCCTTCTGTGGATAGTTTTCAGTTTCTTGTTGGTG11.3333333333333335No Hit
TGATATTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATAGCTCTTATTATTTTGAAATAC11.3333333333333335No Hit
GATTAAAAAAAAAAAAGACTGAGAGACAAAATAGACAAATGAACAATGGC11.3333333333333335No Hit
CCTACATCCTCACCTTTGTTGTGTAGTCAAAGATCTGCAGGAAAAGACTG11.3333333333333335No Hit
GCCAACTATTCATTTCTGTCCTTCTGTGATCCTGAGATGGTTTAAGAAGC11.3333333333333335No Hit
GCGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAAT11.3333333333333335No Hit
CTCCATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG11.3333333333333335No Hit
CTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGCGTTGGATTGTTCACCCA11.3333333333333335No Hit
CGCCCGGCCGCGCGCCGGCCGGGCGCGACCCGCTCCGGGGACAGTGCCAG11.3333333333333335No Hit
GGCTTCCTCTTGCTTTCCAGTTCTCTGTAAACCAATTGCCTTTAAAACCT11.3333333333333335No Hit
GTCGTGGCTGAACCTGCGGGGCAAGCCGCAGGTGGCCATCGGCACCGTGA11.3333333333333335No Hit
TCTTTTCATAGAGCAGTTGGGAAACACTCTGTTTGTAAAGTCTGCAAGTG11.3333333333333335No Hit
CAGGTAAATAGGCTAGAAAAGCCAAGGCCAAAGGCTGGAGGGGAGAGGAC11.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGATCAGAAAAAATAACTATTGAGTACTA11.3333333333333335No Hit
CAACGAGTTTCACGAGCAGTGCGTCGAGCGCATCTTTACCGACATCCAAC11.3333333333333335No Hit
GTTTGTTGGCTATATGTATATCTTCTTTTGAGACTTTTCTATTCATGTAA11.3333333333333335No Hit
GGTGTGGTGGCGTGTGCCTGTGGTCACAGCTACTCGAGGCTTAGGTGGGA11.3333333333333335No Hit
GGTAAGACTTGTAAATCACAAATGGTTATGAGAGAGGAATCTTCTCTACA11.3333333333333335No Hit
CTCCAAGACAACGTCAGTCTTAAATCTTGGTGATATCAATTTATACCAAG11.3333333333333335No Hit
GCACCCCATCTTGGGACTGCCAAAAGAGATTTTAGTGATGATGGCATCAA11.3333333333333335No Hit
GGTGGTGCCTCCCCAAGACCAGCGACGAGCTCAGGGACACCATGTCCCTC11.3333333333333335No Hit
GTTCTGGCCAACTCTTCAGCAACCAGGCCCGCCTCGCTGATTGCTGCGTC11.3333333333333335No Hit
AGAAAGCACTTATTATTATGAGATACGTCCCATCAAAACCTAATTTATAG11.3333333333333335No Hit
GACTGCAAGTAAGGACCACAAGCTGAATCTAGAACTGTATCATATCATAA11.3333333333333335No Hit
CATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAATGAAACTCTGTCTCAAA11.3333333333333335No Hit
AAAATTTCCATTTGCACCAGGTATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCA11.3333333333333335No Hit
GCCTAGGCCTTGCGCGCCAATACCCAGTGCGTTTACTTTTTCGAAGATTT11.3333333333333335No Hit
AGTACAAGTTGTGCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTGGGCACAAAAGGAATC11.3333333333333335No Hit
CCCTTGGGCTCCCTATGTACCAATTCCCAACAGAGATTTAATGTCATCAC11.3333333333333335No Hit
CCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCCCTTT11.3333333333333335No Hit
ATGAACGCTTGGCCGCCACAAGCCAGTTATCCCTGTGGTAACTTTTCTGA11.3333333333333335No Hit
GAGCAGCTGAAATGGAAGCCGACCAGAGGAGATGATGCCAACAAACCCAG11.3333333333333335No Hit
CGCGATGCTCGAGCACGTCCTGGCGTTGGCGGCCGAGCTCAGCGGTGGGC11.3333333333333335No Hit
GACCCCCTTCGCGGGGGGGATGCGTGCATTTATCAGATCAAAACCAACCC11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)