FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003676537

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003676537
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTACCGAGATCTACACTTTTTTTTTCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTAAAA28.333333333333332No Hit
CGCCAGCATCGTTTTCGTCGCGGAGCTTCTCGTCGTCGCCTTGGCGGGGA14.166666666666666No Hit
GACCTTGACCAAGCGGCGCGGGAAATTACTAATGCTGCGTTTGGGTCGGC14.166666666666666No Hit
GTTGGAGAGCTTGTTGTCGGGCCCGACATCGAAGACATGGATGTCGCCCT14.166666666666666No Hit
CTTCACGGCGGGCGCGCAGGCGCCGGCCGAGCTGCATACCCGTTGGTCGC14.166666666666666No Hit
GCATACGGCACCACATAATGTATCGTACATAGTCATCCTACGAAGCGGAA14.166666666666666No Hit
GTACCATAGACGCCTAACCGTCTCTCAGAAAACTCACAGGCCGGGGATTG14.166666666666666No Hit
TCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGAAA14.166666666666666No Hit
GTACATGGGGCAGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
ATGCCGAAGTGCGCCACCAGCCGGTAGCAGGCGGCGAGCTGCACGCGCAG14.166666666666666No Hit
AAGTTCATCGAGGCTGGCCGGCGCCGCACGATCAGCCGGCAGCAGGTGCA14.166666666666666No Hit
ATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAC14.166666666666666No Hit
GTCCTCGGCATCGCGAGCGCTCTCCTCTCGCGATCGCTCCTCGGCATCGC14.166666666666666No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGAAGCAGAGGTATCAACGCAAAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
CTTTTTTGCATGGAAATTCAGAATGAAAACTGTGCCAGCCCTGTGAGGGT14.166666666666666No Hit
GGTCAACGAAGTGCCGATGACGCTGATCGGCAAGCCCGGCCTGCCGGCCA14.166666666666666No Hit
GTTCACGATGCTCTATGACAGGGGAATCATTGTTATGATCGGCAGCACCG14.166666666666666No Hit
GGGTGAAGTCGACCCGCCGCACGCCGTGGCGGGGATCGGTGGAGCCGAAG14.166666666666666No Hit
GGCCGCCCGGGCGAGCTTCCCCGCGGTCGACCTCGAGGAGGAACAGGCCG14.166666666666666No Hit
GCGTATGCGCTTCTACTCCGGGCGTGATCCGAAGAAGAACATCGATGGAG14.166666666666666No Hit
GGCGGGCATCCCCACGATGGCCCGGTGCACCGGGCCGGCCGAGGTGGCCG14.166666666666666No Hit
CTTCCATACGTCGCTCGCGAGCGCGGCTTCCTCCAGCCCGGCGCCGTAGC14.166666666666666No Hit
CCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGACTTGTAAGGA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)