FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003676815

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003676815
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC63

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTTCGATTCGTGACCCGAAGCGGCTCTCGGCCGAGGTGAGCCGGATCGTG213.333333333333334No Hit
GTCGAGACCGAGGAGGAATATGCGATGATCCGTCGCCTCGGCTGTCGCAA16.666666666666667No Hit
CCCAGGTGTTCGCCGTCGAGGCCAGGCCCGCCCGCAACTGACCATCCCGG16.666666666666667No Hit
GATCTCGATCACGTCCGTGCGCGGGGCCGTTGCGGATTCGCGGGCGAGGG16.666666666666667No Hit
CCGTTACACGCAAAGCAGGTGGCGAGAATTAACAAGCGGTGCCAAACAAG16.666666666666667No Hit
GGGCACCACAGGCATCCCAGTTCGCAAGCTCTCGACAACCTCAGCGATGT16.666666666666667No Hit
TTCTTGGAGAGCTCGTGACAGCGCGTATGCTCAACTTGCCGATCAAGGTG16.666666666666667No Hit
GACCGGTCGGCCATGAAGCTGCATACCTTGGTCGCCGAGCCCTGGCCCGA16.666666666666667No Hit
GCCGCGCCAGGAGCTTGCGCACCATCGCGAACAGCACGCCCAGAGCCGCC16.666666666666667No Hit
GCAGCCGCATAGCCATTGGGATTTGCCAGTAGCGGAGTAATGTCCTTAAA16.666666666666667No Hit
ATCCCGCGCGGCGTCGAGGTCGCCGAGAGCTGGGAGGTCTCGGACCACGG16.666666666666667No Hit
ACTCTGGCGCGCTGGAGCTGGCTGATGACAAGAATTGATCCGTTGAGGGA16.666666666666667No Hit
GCCTGCTCTACATCGGCCCGCAGGAAGAGAAGAAGCTCGAGGCCCTGGCG16.666666666666667No Hit
GGCATCGAGGGCCGCTGGGTGCGCGCCTTCCGCACCCGCCACTACTCGGA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)