FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003676915

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003676915
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC59

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCCCCAAGAGGCCCACGACTCAAGGGCTCTGCCCAGGTCAATCGCCCCA213.333333333333334No Hit
GCACAGCTGTGGTCGGAGTTTCGTGCTGCATCCCAGCGTCTTCAGCGCCT213.333333333333334No Hit
ATGAAGGGGAGGCGGTGATGTCTTCCAGAATATTTCCCGGCAAAAGAGCC16.666666666666667No Hit
GTGATGTGCAAGGCTTCTCCAACAACCCTACGACGATAGCCTTTCCCTCC16.666666666666667No Hit
GAGATCGACCGGGCGGCCGCTGAGGTCCCGGCGCACCTGCGCCTGCTGCG16.666666666666667No Hit
GTCCTGGGATTCCCAGCGTAAGCAGTTCTACTGGCACCGGTTCTTCCATC16.666666666666667No Hit
GGCCACCACAGCTCATCCGGCGAGCGCGGCACCAGCGCATCCCCCACCCG16.666666666666667No Hit
GTTGGATGCGTCGAGTGTCGGCTGCGTTTCGTCGATCGGGGTCCTTTGCT16.666666666666667No Hit
GCATAAGCCAGCATAAAAACAAAAGGCACCGCGAAGGTGCCTTTTTTATG16.666666666666667No Hit
TCGATGAAGTGCAGGATCTCAGTGGGCATGTGCTTCTCCTAACCGAGCAG16.666666666666667No Hit
ATCTGGGACTGGTCAGCGCGTCGCTTAGCTGGTGCCGGGGTGAAGGCGTG16.666666666666667No Hit
TGCTGGACGATTGCGCCGCCAATGAAACCGTTCGCGCAGTGTACATAACC16.666666666666667No Hit
GAGCAAACGCCCGCTTGAGAAATTGGACGGCTGGGTCAGGCACCTGTCTC16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)