FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003677855

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003677855
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC60

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGCTCATCAAGGAAAAGACAGCGAACGGTGATAAATACCTCCACTGGTTC312.5No Hit
CGGTGACGAACCAGGCGTCGTCGTCGTCGGGGTTGCCTTTGCGCCCCGGT28.333333333333332No Hit
CTTGCCACTCTCGACGGAATCGGCCGTTTCGAAGTGGTCGGTGTCGAGGA28.333333333333332No Hit
CACAAACTTAGGATCGTAGCAGGTAACTGCGAGGGCGCTGCCGGACTGCA14.166666666666666No Hit
CTCTATGGGAGTTCAGGTTGCTCTGAGTCTTCACAGATACTTGGCATTTT14.166666666666666No Hit
CCTATAATCACAGCACTTTGGAAGGCAGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGC14.166666666666666No Hit
CCCGGCGGCTTCGGCCCGGGGCCTAGGAATTTGGTTCCCCGGCGGCGCTA14.166666666666666No Hit
TCGTCGATAAGCGGATAGGCACAAAGACATTGACCACGTGCGTGCAGGAC14.166666666666666No Hit
TCTCGACCGGCGCGCCCGAGCGCCATCAGCGGCCGTCGATGACCTGCTCA14.166666666666666No Hit
CACGACCTACCGGACGCCCCTCGACGCCTATCCGGTCGAGGGTGGCTACG14.166666666666666No Hit
GTTGTAGATCATGAGGTAGATGACGATCGCAACCGCGGTGCCGATGGCCG14.166666666666666No Hit
GTCAAGGAGGAGTTCCGGCTCCGCACCCAGACACCGCCCTACGGTCGGCT14.166666666666666No Hit
TCTCGACCAGCGCGCCCGAGCGCCAGCCGCGGCCGTCGATGACCTGCTCA14.166666666666666No Hit
CATTTTTCCTCCGAAAAGACGACGCGCGCCGGCGCGGCAGCTCGCCCCGT14.166666666666666No Hit
CGTCGCCTATGCCTCCCTGCGACGAGGGGGTGTTGACGAGGACGCGGCCA14.166666666666666No Hit
GTGGTGTCCGTGACCACCATGGACTCCGATACCGCCCGCGCCGCCGCCTG14.166666666666666No Hit
GGTCGACCAGGATGCCGACCGACAGCGCTAGTCCGCCCAGGGTCATCAGG14.166666666666666No Hit
ACTTTATTCCGAAGGATATTGCGGTCGAGAGCGAGGTGTTTAAAGAATGG14.166666666666666No Hit
CTACAACGTCATGGGCGTCGCCAAGGCCGCGCTGGAAGCCTCCGTGCGCT14.166666666666666No Hit
ATATCATGCCGCGCGACCAGGCGGAACGTTAATGGCGACCGGTCAGCTAC14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)