FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003677856

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003677856
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC60

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGTTCATTCTGGTCAAAGCGTTAAAGCTTAGCTCTCGTAATGAGAAGGT312.5No Hit
GGGACGCCTTCGGCCTGCCGGCCGAGAACGCCGCGATGAAGGGCAAGGTG28.333333333333332No Hit
TCGCATGGGCATTCGCCGCCGCCACCACCGCCGATGTCGCCGGAGAGATC28.333333333333332No Hit
ACCCCGCCTTTGTTCCCACCGCATCCGATGCGGCGTAGACGGCGGGGCCT28.333333333333332No Hit
TAGTATACGTCCAGAAAAGTGCACATAAACGTTTACAGCTTGATGAATTT14.166666666666666No Hit
GCGGCGGCGCGGGCGGTATCGGAGTCCATGGTGGTCACGGACACCACCTG14.166666666666666No Hit
GTGCTCGCGATGTACCGCGCCGCGGACTTCAAAGACGCGGTCGCGAAGGC14.166666666666666No Hit
GAGTTGGAGCACGGCGAGGATCCGGGGCACCGCCTGGATCAGTGCACTTA14.166666666666666No Hit
GAACAGATACTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTGACAGAGTCACACTCTTTC14.166666666666666No Hit
TGATCGGCCCGGCCGAGATCGCGTTGACGCGGATCTGCTTGGGGCCGAGG14.166666666666666No Hit
GATCAGCACCCACCTGCGCGGCAAAGCCGATCGGCGCCAGGTCGAAGGCG14.166666666666666No Hit
CTGCTCGACGAACCAGACACCTTGCTTTCAGCTGCTGACCGCTGGCTCAT14.166666666666666No Hit
GTTCTGCACCCAGTCCGAGCCTGATCCGTACACCAGAATGAAGACGTAGC14.166666666666666No Hit
GGCGACAATCGTGTCGCCGATACCGGCGAAGCGTCGAACAGAACCGCCGA14.166666666666666No Hit
GGAAACTGGCGCAGCACCCTGATCATCGCCGCCACCATACCGCTGTCCAT14.166666666666666No Hit
GGTGTGGGGTTTGAACACGGCGATATTTCGCCGAATTCTACCCACACCAC14.166666666666666No Hit
AGCTAACAATATGCAGACCGTAATCCTTTGCAACGCTAGCAACGTCATCG14.166666666666666No Hit
GTCACCGACCGCGGCGTCGTGCGCGCCGGTTCGCGCGCGGTGATCGCCAG14.166666666666666No Hit
GCTCCATGATGCTCGTCTTCGCCGGTTCCCACATCAACCCGGCTCAGACC14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)