FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003680845

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003680845
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCTGAAGTTTATATTCTTATCCTACCAGGCTTCGGAATAATCTCCCATA16.666666666666667No Hit
GGCCCCTTCCTCAGGAGTCTTGGCCAGTTCCTAGGAAAAGGAGGAACTTG16.666666666666667No Hit
GCTTTGCGTCATTTAATTTTGAAAACAGTTATCTTCCGCCATAGATAACT16.666666666666667No Hit
CTCTGGAAGCTGCGACATGCTGCCATGGCATTCCCCAGAGAGAGGTGGCA16.666666666666667No Hit
GAACAGATATCAATATTTCTTTTTGCTCCTATAATATGCATCTTCCTTGT16.666666666666667No Hit
CCTATTAGTAATGAGCATCCCTACTACCCAGTTTGTGTTTTCTAAATACC16.666666666666667No Hit
CTCCTTTTCCACCTGAACTCTTCCTCCTACACATCACAGCAGCGACCACA16.666666666666667No Hit
TCTAGGAAGTGAGTCTCCAGGAAGTCACAGAGATGGGGGTCCGTGCGGGC16.666666666666667No Hit
GTCGGAGAGGAAGCCCGGCGGGGAGCGCGAGGAACGGGGCAAGCTGCCCG16.666666666666667No Hit
CTCCCGACCCGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGACTCTTTC16.666666666666667No Hit
GGACACTGCATCATACTAGTGTCGGCCCCTGAGGGCACCCCTTCCTCGCC16.666666666666667No Hit
TCCTCCATCAAGTCAGCAATCTGAATTTTGTCATACTCTTCTTTCATTTT16.666666666666667No Hit
GAATGAGTCCACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTC16.666666666666667No Hit
GGCCCCAGGAGCTCTCTCTCCTCCCCATGGCCATCTTTTTCTTCTTCCAA16.666666666666667No Hit
AAACAATGCTGCAATGGACAGTCCCATACACGACCCCTTGTGAAAATTTT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)