FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003680846

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003680846
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCTGTCCCCAGCCTGTATCATCTCTTTGATAAGCCAGACACCCCCATTCC16.666666666666667No Hit
ACGCTTCGGGCCCCGCGGGACACTCAGCTAAGAGCATCGAGGGGGCGCCG16.666666666666667No Hit
ATCTGGACTACTGTTGAAGAAATTCCCAGTAAGGCTCACTTATATCTTTA16.666666666666667No Hit
GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGCGATCCAGCCACCTAGGC16.666666666666667No Hit
GATATGAAGAAAGTGTTTGCCATACGTATTAACTAACAAAGGATTAGTGT16.666666666666667No Hit
CTCTTGGGGCTCCCTCATCCAGCCCGTCGCAGCTTTGACATCTTGGTGTA16.666666666666667No Hit
TACTTCTTAGTACTTGAAACCTCTGAAGAACAGAGGGACCATCTTTCCAA16.666666666666667No Hit
GGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGA16.666666666666667No Hit
GATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGACCAAACTCAGGACACCG16.666666666666667No Hit
AAAGTAAGAGGCACAGTACATCTTGGAAACAACCAGGCAAAGAGCCAAAG16.666666666666667No Hit
GTATCTGATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGATTAATGAAAAC16.666666666666667No Hit
ATTGATAGGACATAGTGGAAGTGGGCTACAACGTAGTACGTGTCGTGTAG16.666666666666667No Hit
GTTTTTGTGGTTAGCTCCTTCTTGCCAACCAACCATGAGCTCCCAGATTC16.666666666666667No Hit
TCCTTGGCCAACCTTAACCCAGAGGTCCAGGTGCACCTTGTACTGCTTTT16.666666666666667No Hit
CGGACGAGCAGCTGCAGAAGCTCGGCGTCCAGGTCCGAGAGGAGCTGCTG16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)