FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003937023

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003937023
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
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Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC51

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Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

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Sequence length distribution

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Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

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