FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003938947

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003938947
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75000
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA21702.893333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA18472.462666666666667No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA16402.1866666666666665No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA13911.8546666666666667No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA12151.6199999999999999No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA11871.5826666666666667No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA11681.5573333333333332No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA10981.464No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA10981.464No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA10491.3986666666666667No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA10021.336No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA9561.2746666666666666No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA9311.2413333333333334No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA9081.2106666666666666No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA8871.1826666666666665No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA8811.1746666666666667No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA8661.1546666666666667No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA8631.1506666666666667No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA8581.1440000000000001No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA8051.0733333333333333No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA7811.0413333333333334No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA7681.024No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA7370.9826666666666666No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA7350.98No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA7320.976No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA7290.972No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA6400.8533333333333334No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA6350.8466666666666668No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA5850.7799999999999999No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA5370.716No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA5330.7106666666666667No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA5170.6893333333333332No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA5170.6893333333333332No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA5120.6826666666666666No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4980.664No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4870.6493333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA4740.632No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA4690.6253333333333333No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4570.6093333333333334No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA4470.596No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4460.5946666666666667No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4340.5786666666666667No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4310.5746666666666667No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4290.5720000000000001No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA4160.5546666666666666No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA4150.5533333333333333No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3990.532No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3910.5213333333333334No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3900.52No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA3880.5173333333333333No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3570.47600000000000003No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA3400.45333333333333337No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3380.45066666666666666No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA3320.44266666666666665No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3230.4306666666666667No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3190.4253333333333333No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA3190.4253333333333333No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA3180.424No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA3100.41333333333333333No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA3090.41200000000000003No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCA3040.4053333333333333No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA3020.4026666666666666No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA2970.396No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2940.392No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2880.384No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2860.38133333333333336No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2850.38No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2810.3746666666666667No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2710.36133333333333334No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2700.36No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2690.3586666666666667No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2680.35733333333333334No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2590.3453333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA2550.33999999999999997No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2540.33866666666666667No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2530.3373333333333333No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA2470.32933333333333337No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2420.32266666666666666No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2360.31466666666666665No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2290.30533333333333335No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2260.30133333333333334No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2260.30133333333333334No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA2250.3No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2240.29866666666666664No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2230.29733333333333334No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2150.2866666666666667No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2110.2813333333333333No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2090.2786666666666666No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2070.27599999999999997No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA2050.2733333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA2050.2733333333333333No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2050.2733333333333333No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA2040.272No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA2020.2693333333333333No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2000.26666666666666666No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2000.26666666666666666No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1990.26533333333333337No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1990.26533333333333337No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1990.26533333333333337No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1990.26533333333333337No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1980.264No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA1960.26133333333333336No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1920.256No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA1920.256No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA1890.252No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1850.24666666666666665No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1800.24No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1730.23066666666666666No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1710.22799999999999998No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCA1680.22399999999999998No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1640.21866666666666668No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1640.21866666666666668No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1620.216No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1600.21333333333333335No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1580.2106666666666667No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1570.20933333333333334No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1540.2053333333333333No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1530.20400000000000001No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1520.20266666666666666No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1500.2No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1470.196No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1470.196No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1450.19333333333333333No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1400.18666666666666668No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1380.184No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1320.17600000000000002No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1300.17333333333333334No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1270.16933333333333334No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1260.168No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1260.168No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1230.164No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1220.16266666666666665No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1200.16No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCA1200.16No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1190.15866666666666665No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1170.156No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1120.14933333333333332No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1110.148No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTATTTGCTCCCCACGCTTTCGGGACTGA1100.14666666666666667No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1090.14533333333333334No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1040.13866666666666666No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1030.13733333333333334No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1030.13733333333333334No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCA1020.136No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCA1010.13466666666666666No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1000.13333333333333333No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1000.13333333333333333No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA1000.13333333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCA990.132No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA970.12933333333333333No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA970.12933333333333333No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA960.128No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA930.124No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTATTTGCTCCCCACGCTTTCGGGACTGA920.12266666666666667No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA910.12133333333333333No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA900.12No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA890.11866666666666666No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA880.11733333333333333No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCA860.11466666666666667No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCA860.11466666666666667No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA850.11333333333333334No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA850.11333333333333334No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCA830.11066666666666666No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA810.108No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA810.108No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCA800.10666666666666667No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA800.10666666666666667No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCA760.10133333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)