FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833331

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833331
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences115978
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA84517.286726793012469No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA56214.846608839607511No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA55724.804359447481419No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA50934.391350083636552No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA43433.7446757143596203No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA37063.1954336167204125No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA31382.705685561054683No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA29322.5280656676266187No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA17571.514942489092759No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA6870.5923537222576696No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA5670.4888858231733605No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4950.42680508372277504No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4220.3638621117798203No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA3770.32506164962320444No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3650.31471485971477353No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3120.26901653761920363No Hit
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GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2940.2534963527565573No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2930.252634120264188No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT2920.2517718877718188No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2830.2440117953404956No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2810.24228733035575714No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT2800.2414250978633879No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT2770.23883840038628015No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2730.23538947041680322No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT2640.22762937798548No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2620.22590491300074153No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2580.22245598303126454No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC2460.21210919312283366No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT2420.20866026315335667No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2310.19917570573729498No Hit
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GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2100.1810688233975409No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2070.1784821259204332No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2030.17503319595095623No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2030.17503319595095623No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1990.17158426598147924No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1930.1664108710272638No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1890.16296194105778683No Hit
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GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1830.15778854610357138No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1760.15175291865698667No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1730.14916622117987893No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1680.14485505871803273No Hit
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GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1640.14140612874855576No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1630.14054389625618652No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1570.13537050130197106No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1540.13278380382486335No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1530.13192157133249408No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1520.13105933884012486No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1500.12933487385538636No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1500.12933487385538636No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1470.12674817637827865No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1460.1258859438859094No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA1460.1258859438859094No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1420.12243701391643241No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1420.12243701391643241No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1400.12071254893169395No Hit
GANTACCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1400.12071254893169395No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1370.11812585145458622No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1370.11812585145458622No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1360.11726361896221696No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1340.11553915397747849No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1310.11295245650037077No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1290.11122799151563227No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1270.10950352653089379No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1230.10605459656141683No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1220.10519236406904757No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1210.10433013157667834No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1180.10174343409957061No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1170.10088120160720138No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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