FastQCFastQC Report
Sat 3 Sep 2022
EGAF00004833345

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833345
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences200503
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA196879.818805703655308No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA133386.652269542101615No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA131246.545537972000419No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA115985.784452102961053No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA102205.097180590814102No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA88304.40392413081101No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA72393.6104197942175427No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA69753.4787509413824234No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA42282.108696627980629No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG15390.7675695625501863No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG13950.6957501882764846No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG12320.6144546465638918No Hit
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GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG7740.3860291367211463No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA7010.34962070392961697No Hit
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GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA6240.31121728851937375No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA6090.3037361036991965No Hit
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GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA5890.29376119060562683No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA5260.2623402143608824No Hit
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GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4660.23241547508017335No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG4590.22892425549742396No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4570.22792676418806704No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4410.21994683371321125No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4400.21944808805853278No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4340.21645561413046188No Hit
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GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4190.20897442931028465No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4170.20797693800092767No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4090.2039869727634998No Hit
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GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4040.2014932444901074No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3810.19002209443250226No Hit
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GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3480.1735634878281123No Hit
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GANTANCAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2530.12618265063365636No Hit
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GANTANCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2420.12069644843219303No Hit
GANTACCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2390.11920021146815758No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2380.1187014658134791No Hit
GANTACTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2340.11670648319476516No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2250.11221777230265881No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2250.11221777230265881No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2210.11022278968394487No Hit
GACTANCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2150.10723031575587398No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG2140.1067315701011955No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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