FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833365

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833365
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences128480
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA103848.082191780821917No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA71575.5705168119551685No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA70475.484900373599004No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA60254.689445828144458No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA54744.260585305105853No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA46523.6207970112079697No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA38613.00513698630137No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA35312.7482876712328768No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA22811.775373599003736No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4560.35491905354919057No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3800.2957658779576588No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG3620.28175591531755917No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3550.27630759651307596No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3340.2599626400996264No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG3310.2576276463262765No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3220.25062266500622665No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3170.24673100871731007No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3090.24050435865504358No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3010.23427770859277708No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2680.2085927770859278No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2590.20158779576587796No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2550.19847447073474472No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT2510.19536114570361146No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2490.19380448318804483No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2460.19146948941469488No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2370.18446450809464507No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2360.18368617683686175No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2330.18135118306351183No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2280.17745952677459528No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2280.17745952677459528No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2280.17745952677459528No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT2280.17745952677459528No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2260.17590286425902865No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2260.17590286425902865No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2250.17512453300124534No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2190.17045454545454544No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2120.16500622665006226No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2110.16422789539227894No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2110.16422789539227894No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG2090.16267123287671234No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2080.16189290161892902No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT2080.16189290161892902No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2060.1603362391033624No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2020.15722291407222913No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2000.1556662515566625No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1990.1548879202988792No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1970.15333125778331258No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1940.15099626400996263No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1920.14943960149439603No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1910.1486612702366127No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1910.1486612702366127No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1860.14476961394769616No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1810.14087795765877958No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1780.13854296388542964No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1760.136986301369863No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1720.13387297633872977No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1710.13309464508094646No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1700.13231631382316314No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1700.13231631382316314No Hit
GANTACCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1610.12531133250311333No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1590.1237546699875467No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1590.1237546699875467No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1570.12219800747198008No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1560.12141967621419676No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1530.11908468244084683No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1520.11830635118306353No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1510.11752801992528021No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1440.11207970112079702No Hit
GANTACTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1440.11207970112079702No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCCAGCCCCATGACCAGGTCTTGCGGCACC1370.10663138231631383No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1360.10585305105853052No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1360.10585305105853052No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1310.10196139476961394No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1300.10118306351183062No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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