FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833379

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833379
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences78575
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC46

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA48776.206808781419026No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA34994.453070314985682No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA34784.426344257079224No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA29943.8103722558065547No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA26943.428571428571429No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA22102.812599427298759No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA16942.155902004454343No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA16302.0744511613108494No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA10221.3006681514476615No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2850.3627107858733694No Hit
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GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2390.30416799236398345No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG2380.3028953229398664No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2370.3016226535157493No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG2340.297804645243398No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2330.2965319758192809No Hit
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GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2120.26980591791282216No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2120.26980591791282216No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2010.2558065542475342No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1980.25198854597518294No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1970.25071587655106586No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1880.23926185173401207No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1820.23162583518930957No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCAG1690.21508113267578746No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1660.2112631244034362No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1650.20999045497931912No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1630.20744511613108493No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1630.20744511613108493No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1620.20617244670696785No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1600.20362710785873367No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1560.19853643016226533No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1540.19599109131403117No Hit
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GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1450.1845370664969774No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1440.18326439707286032No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1430.18199172764874325No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1420.18071905822462617No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1410.17944638880050906No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1400.17817371937639198No Hit
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GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1380.17562838052815782No Hit
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GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1370.17435571110404072No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1360.17308304167992364No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCAG1360.17308304167992364No Hit
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GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1330.16926503340757237No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1290.16417435571110403No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1290.16417435571110403No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG1290.16417435571110403No Hit
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GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1250.1590836780146357No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1250.1590836780146357No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAACCTCAG1250.1590836780146357No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1240.1578110085905186No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCAG1070.13617562838052816No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1050.13363028953229397No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA990.12599427298759147No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCGCGCTTTCGCGCCTCAG980.12472160356347438No Hit
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GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA980.12472160356347438No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG970.1234489341393573No Hit
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GACTANCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA910.11581291759465479No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA910.11581291759465479No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA900.11454024817053769No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCGCGCTTTCGCGCCTCAG890.11326757874642061No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG860.10944957047406935No Hit
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GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCAG830.1056315622017181No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG830.1056315622017181No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA820.104358892777601No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTATTTGCTCCCCACGCTTTCGGGACTGAG820.104358892777601No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCAG820.104358892777601No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAACCTCAG810.10308622335348393No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAACCTCAG800.10181355392936683No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG800.10181355392936683No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG790.10054088450524976No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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