FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833413

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833413
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences135359
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC47

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA105727.810341388455884No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA70175.183992198523925No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA69755.152963600499413No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA61174.519093669427226No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA55274.083215744797169No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA46763.4545172467290683No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA37862.797006479066778No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA36402.689145162124425No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA22251.6437769191557268No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG7880.5821556010313315No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG7760.5732902873100422No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG6660.49202491153155686No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG6490.47946571709306357No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG5930.4380942530603802No Hit
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GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG4480.33097171226146765No Hit
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GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3190.23566958975760754No Hit
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GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3080.227543052179759No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2840.2098124247371804No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2670.19725323029868722No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2510.18543281200363476No Hit
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GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2390.17656749828234547No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2280.16844096070449693No Hit
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GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2220.1640083038438523No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA2180.16105319927008915No Hit
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GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1770.13076337738901736No Hit
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GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1730.12780827281525425No Hit
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GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1690.12485316824149115No Hit
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GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1640.12115928752428726No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1630.12042051138084649No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1630.12042051138084649No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1620.11968173523740572No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1620.11968173523740572No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1590.1174654068070834No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA1550.11451030223332027No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1510.11155519765955718No Hit
GANTACCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1470.10860009308579407No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1450.10712254079891252No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1430.10564498851203097No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA1430.10564498851203097No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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