FastQCFastQC Report
Sat 3 Sep 2022
EGAF00004833445

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833445
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences162350
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC47

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA109186.724976901755467No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA73104.502617801047121No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA64413.9673544810594397No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA56453.477055743763474No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA47612.9325531259624267No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA37592.3153680320295655No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA37132.287034185401909No Hit
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GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA23951.4752078842008007No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG19021.1715429627348322No Hit
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GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG11150.6867878041268863No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG10840.6676932553125963No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG8440.5198644902987373No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG7320.45087773329226977No Hit
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GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG5170.31844779796735445No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG5150.317215891592239No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG5100.31413612565445026No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG4890.30120110871573763No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4500.2771789344009855No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4240.26116415152448413No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3600.22174314752078841No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3540.21804742839544194No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3360.20696027101940254No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA3310.20388050508161382No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1780.10963966738527872No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1710.1053279950723745No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1710.1053279950723745No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1690.104096088697259No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1690.104096088697259No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1650.10163227594702803No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1630.10040036957191253No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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