FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833461

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833461
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences170237
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC46

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA94915.575168735351305No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA85064.996563614255421No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA75294.422657824092295No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA64903.8123322192002913No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA53103.11918090661842No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA48702.8607177053167057No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA32071.8838442876695431No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG11860.6966758107814399No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG11370.6678924088182945No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG9550.5609826300980397No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG9190.5398356409006269No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG8600.5051780752715332No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG7270.427051698514424No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG6250.3671352291217538No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG6110.3589113999894265No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG6070.3565617345230473No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG5740.33717699442541865No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG5600.3289531652930914No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG4710.27667310866615363No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4650.2731486104665848No Hit
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GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4490.26374994860106793No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG4000.23496654663792244No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3810.2238056356726211No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3680.21616922290688864No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3540.20794539377456137No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3490.20500831194158733No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG3460.20324606284180288No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3380.19854673190904445No Hit
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GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3340.1961970664426652No Hit
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GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3320.1950222337094756No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3300.193847400976286No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3260.19149773550990679No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG3210.18856065367693275No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3200.18797323731033794No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3170.1862109882105535No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3130.1838613227441743No Hit
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GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3060.17974940817801066No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3050.17916199181141584No Hit
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GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2940.172700411778873No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2830.1662388317463301No Hit
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GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2740.16095208444697687No Hit
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GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2690.15801500261400284No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT2460.1445044261823223No Hit
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GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2050.12042035515193523No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG2020.11865810605215082No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2010.11807068968555602No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1930.11337135875279757No Hit
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GANTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1870.10984686055322873No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1870.10984686055322873No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1820.1069097787202547No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG1810.1063223623536599No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1770.10397269688728068No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1770.10397269688728068No Hit
GANTANCAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1750.10279786415409106No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1730.10162303142090144No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1730.10162303142090144No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGAG1730.10162303142090144No Hit
GANTACTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1720.10103561505430665No Hit
GACTANCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1710.10044819868771185No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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