FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00004833463

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833463
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences36000
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA22886.355555555555556No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA16454.569444444444445No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA15254.236111111111112No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA12863.5722222222222224No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA12213.3916666666666666No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA9602.666666666666667No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA7442.0666666666666664No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA7202.0No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA4101.1388888888888888No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2320.6444444444444445No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1990.5527777777777778No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1890.525No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1500.4166666666666667No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1450.4027777777777778No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1320.36666666666666664No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1270.35277777777777775No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1230.3416666666666667No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1180.3277777777777778No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1160.32222222222222224No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1150.3194444444444445No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1130.3138888888888889No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1120.3111111111111111No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1090.30277777777777776No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1060.29444444444444445No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1050.2916666666666667No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA970.2694444444444445No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA970.2694444444444445No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA940.26111111111111107No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA940.26111111111111107No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA920.2555555555555556No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA920.2555555555555556No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT910.25277777777777777No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT880.24444444444444444No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA860.23888888888888887No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG830.23055555555555554No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA800.2222222222222222No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA790.21944444444444447No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA780.21666666666666665No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA770.2138888888888889No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA740.20555555555555557No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA730.20277777777777778No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA700.19444444444444445No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA680.18888888888888888No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA670.18611111111111112No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT650.18055555555555555No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA650.18055555555555555No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA650.18055555555555555No Hit
GANTANCAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA650.18055555555555555No Hit
GANTANTGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA640.17777777777777778No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC630.17500000000000002No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA630.17500000000000002No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA630.17500000000000002No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA610.16944444444444443No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG610.16944444444444443No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA610.16944444444444443No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG600.16666666666666669No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA590.1638888888888889No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA590.1638888888888889No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG590.1638888888888889No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT580.16111111111111112No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT570.15833333333333333No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA520.14444444444444443No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA510.14166666666666666No Hit
GANTANCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA500.1388888888888889No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA490.1361111111111111No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA490.1361111111111111No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAA480.13333333333333333No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTTAATGTTGTGGACTTGTAATTTGTTGGC470.13055555555555554No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG460.1277777777777778No Hit
GACTANTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA460.1277777777777778No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT460.1277777777777778No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA460.1277777777777778No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA460.1277777777777778No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT440.12222222222222222No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA440.12222222222222222No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA430.11944444444444444No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA430.11944444444444444No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTCAGTTTCATTAATCTAAAAATGAAGCAC400.1111111111111111No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA390.10833333333333332No Hit
GACTANCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA380.10555555555555554No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG380.10555555555555554No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA380.10555555555555554No Hit
GANTANCGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA370.10277777777777779No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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