FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833491

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833491
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences101568
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA74427.327110901071203No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA52245.143352236925016No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA50334.955300882167612No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA44494.38031663516068No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA41564.0918399495904225No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA34563.402646502835539No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA27562.7134530560806556No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA24922.453528670447385No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA16611.635357592942659No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4170.410562381852552No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3950.3889020163831128No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3690.36330340264650285No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3120.30718336483931946No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2960.29143037177063646No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2890.2845384373030876No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2820.27764650283553877No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2680.26386263390044107No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2610.25697069943289225No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2590.25500157529930684No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2550.25106332703213613No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2500.24614051669817263No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2490.24515595463137996No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2440.2402331442974165No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2270.22349558916194076No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC2200.21660365469439194No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2180.21463453056080653No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2080.20478890989287962No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2020.19888153749212353No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1990.19592785129174542No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1920.1890359168241966No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1900.18706679269061122No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1890.1860822306238185No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1860.18312854442344045No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1830.1801748582230624No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1820.1791902961562697No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1810.17820573408947699No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1800.1772211720226843No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1730.17032923755513546No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1670.16442186515437934No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1660.16343730308758664No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1630.16048361688720858No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1630.16048361688720858No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG1630.16048361688720858No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1620.15949905482041588No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1560.15359168241965973No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1560.15359168241965973No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1560.15359168241965973No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1540.15162255828607435No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1530.15063799621928167No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1480.14571518588531823No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1470.14473062381852553No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1440.14177693761814747No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1420.13980781348456206No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1410.13882325141776938No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1370.13488500315059862No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1360.13390044108380594No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1350.1329158790170132No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1340.13193131695022053No Hit
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GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1310.12897763074984248No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1290.1270085066162571No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1210.11913201008191555No Hit
GANTACCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1210.11913201008191555No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1210.11913201008191555No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG1210.11913201008191555No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1190.11716288594833019No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1140.11224007561436673No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1140.11224007561436673No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1140.11224007561436673No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG1120.11027095148078135No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTCTGTCACATACCTCATCTCAACAGCCAA1120.11027095148078135No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1110.10928638941398866No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1110.10928638941398866No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1090.10731726528040327No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG1080.10633270321361059No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1060.1043635790800252No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG1060.1043635790800252No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1030.10140989287964713No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG1030.10140989287964713No Hit
GANTACCAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1020.10042533081285444No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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